Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C3orf18Q9UK00 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C3orf18Q9UK00 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C3orf18Q9UK00 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C3orf18Q9UK00 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C3orf18Q9UK00 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C3orf18Q9UK00 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C3orf18Q9UK00 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C3orf18Q9UK00 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C3orf18Q9UK00 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
C3orf18Q9UK00 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C3orf18Q9UK00 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
C3orf18Q9UK00 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C3orf18Q9UK00 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C3orf18Q9UK00 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C3orf18Q9UK00 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C3orf18Q9UK00 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C3orf18Q9UK00 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C3orf18Q9UK00 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C3orf18Q9UK00 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C3orf18Q9UK00 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C3orf18Q9UK00 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
C3orf18Q9UK00 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C3orf18Q9UK00 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C3orf18Q9UK00 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C3orf18Q9UK00 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C3orf18Q9UK00 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C3orf18Q9UK00 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C3orf18Q9UK00 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C3orf18Q9UK00 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C3orf18Q9UK00 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C3orf18Q9UK00 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C3orf18Q9UK00 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C3orf18Q9UK00 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C3orf18Q9UK00 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C3orf18Q9UK00 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C3orf18Q9UK00 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C3orf18Q9UK00 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C3orf18Q9UK00 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C3orf18Q9UK00 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C3orf18Q9UK00 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C3orf18Q9UK00 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C3orf18Q9UK00 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C3orf18Q9UK00 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C3orf18Q9UK00 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C3orf18Q9UK00 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C3orf18Q9UK00 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C3orf18Q9UK00 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C3orf18Q9UK00 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C3orf18Q9UK00 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C3orf18Q9UK00 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
C3orf18Q9UK00 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C3orf18Q9UK00 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C3orf18Q9UK00 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C3orf18Q9UK00 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C3orf18Q9UK00 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C3orf18Q9UK00 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
C3orf18Q9UK00 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C3orf18Q9UK00 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C3orf18Q9UK00 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C3orf18Q9UK00 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
C3orf18Q9UK00 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C3orf18Q9UK00 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C3orf18Q9UK00 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C3orf18Q9UK00 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C3orf18Q9UK00 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C3orf18Q9UK00 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C3orf18Q9UK00 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C3orf18Q9UK00 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C3orf18Q9UK00 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C3orf18Q9UK00 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C3orf18Q9UK00 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C3orf18Q9UK00 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C3orf18Q9UK00 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
C3orf18Q9UK00 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C3orf18Q9UK00 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C3orf18Q9UK00 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C3orf18Q9UK00 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C3orf18Q9UK00 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C3orf18Q9UK00 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C3orf18Q9UK00 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C3orf18Q9UK00 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C3orf18Q9UK00 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C3orf18Q9UK00 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C3orf18Q9UK00 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C3orf18Q9UK00 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C3orf18Q9UK00 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C3orf18Q9UK00 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C3orf18Q9UK00 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C3orf18Q9UK00 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C3orf18Q9UK00 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C3orf18Q9UK00 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C3orf18Q9UK00 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C3orf18Q9UK00 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C3orf18Q9UK00 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C3orf18Q9UK00 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C3orf18Q9UK00 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C3orf18Q9UK00 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C3orf18Q9UK00 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C3orf18Q9UK00 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms