Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGQ2

CACFD1, Calcium channel flower homolog, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACFD1Q9UGQ2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACFD1Q9UGQ2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACFD1Q9UGQ2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACFD1Q9UGQ2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACFD1Q9UGQ2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACFD1Q9UGQ2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACFD1Q9UGQ2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACFD1Q9UGQ2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACFD1Q9UGQ2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACFD1Q9UGQ2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACFD1Q9UGQ2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACFD1Q9UGQ2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACFD1Q9UGQ2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACFD1Q9UGQ2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACFD1Q9UGQ2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACFD1Q9UGQ2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACFD1Q9UGQ2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACFD1Q9UGQ2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACFD1Q9UGQ2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACFD1Q9UGQ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACFD1Q9UGQ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACFD1Q9UGQ2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACFD1Q9UGQ2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACFD1Q9UGQ2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACFD1Q9UGQ2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACFD1Q9UGQ2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACFD1Q9UGQ2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACFD1Q9UGQ2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACFD1Q9UGQ2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACFD1Q9UGQ2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACFD1Q9UGQ2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACFD1Q9UGQ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACFD1Q9UGQ2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACFD1Q9UGQ2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACFD1Q9UGQ2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACFD1Q9UGQ2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACFD1Q9UGQ2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACFD1Q9UGQ2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACFD1Q9UGQ2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACFD1Q9UGQ2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACFD1Q9UGQ2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACFD1Q9UGQ2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACFD1Q9UGQ2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACFD1Q9UGQ2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACFD1Q9UGQ2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACFD1Q9UGQ2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACFD1Q9UGQ2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACFD1Q9UGQ2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACFD1Q9UGQ2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACFD1Q9UGQ2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACFD1Q9UGQ2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACFD1Q9UGQ2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACFD1Q9UGQ2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACFD1Q9UGQ2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACFD1Q9UGQ2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACFD1Q9UGQ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACFD1Q9UGQ2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACFD1Q9UGQ2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACFD1Q9UGQ2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACFD1Q9UGQ2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACFD1Q9UGQ2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACFD1Q9UGQ2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACFD1Q9UGQ2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACFD1Q9UGQ2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACFD1Q9UGQ2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACFD1Q9UGQ2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACFD1Q9UGQ2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACFD1Q9UGQ2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACFD1Q9UGQ2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACFD1Q9UGQ2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACFD1Q9UGQ2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACFD1Q9UGQ2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACFD1Q9UGQ2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACFD1Q9UGQ2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACFD1Q9UGQ2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACFD1Q9UGQ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACFD1Q9UGQ2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACFD1Q9UGQ2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACFD1Q9UGQ2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACFD1Q9UGQ2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACFD1Q9UGQ2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACFD1Q9UGQ2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACFD1Q9UGQ2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACFD1Q9UGQ2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACFD1Q9UGQ2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACFD1Q9UGQ2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACFD1Q9UGQ2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACFD1Q9UGQ2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACFD1Q9UGQ2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACFD1Q9UGQ2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACFD1Q9UGQ2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACFD1Q9UGQ2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACFD1Q9UGQ2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACFD1Q9UGQ2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACFD1Q9UGQ2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACFD1Q9UGQ2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACFD1Q9UGQ2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACFD1Q9UGQ2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACFD1Q9UGQ2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACFD1Q9UGQ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms