Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS18Q9P253 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS18Q9P253 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VPS18Q9P253 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VPS18Q9P253 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VPS18Q9P253 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VPS18Q9P253 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VPS18Q9P253 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS18Q9P253 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS18Q9P253 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS18Q9P253 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS18Q9P253 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS18Q9P253 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS18Q9P253 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS18Q9P253 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS18Q9P253 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
VPS18Q9P253 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS18Q9P253 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VPS18Q9P253 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS18Q9P253 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS18Q9P253 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS18Q9P253 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS18Q9P253 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS18Q9P253 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS18Q9P253 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS18Q9P253 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
VPS18Q9P253 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
VPS18Q9P253 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VPS18Q9P253 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VPS18Q9P253 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VPS18Q9P253 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS18Q9P253 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS18Q9P253 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS18Q9P253 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS18Q9P253 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS18Q9P253 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS18Q9P253 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS18Q9P253 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
VPS18Q9P253 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS18Q9P253 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS18Q9P253 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS18Q9P253 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS18Q9P253 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS18Q9P253 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS18Q9P253 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS18Q9P253 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VPS18Q9P253 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VPS18Q9P253 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS18Q9P253 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS18Q9P253 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS18Q9P253 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS18Q9P253 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS18Q9P253 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS18Q9P253 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS18Q9P253 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS18Q9P253 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS18Q9P253 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS18Q9P253 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS18Q9P253 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS18Q9P253 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS18Q9P253 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS18Q9P253 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS18Q9P253 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS18Q9P253 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VPS18Q9P253 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS18Q9P253 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS18Q9P253 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS18Q9P253 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS18Q9P253 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS18Q9P253 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VPS18Q9P253 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
VPS18Q9P253 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS18Q9P253 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS18Q9P253 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS18Q9P253 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS18Q9P253 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS18Q9P253 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS18Q9P253 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS18Q9P253 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS18Q9P253 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS18Q9P253 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS18Q9P253 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS18Q9P253 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS18Q9P253 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS18Q9P253 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS18Q9P253 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS18Q9P253 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS18Q9P253 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS18Q9P253 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS18Q9P253 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS18Q9P253 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS18Q9P253 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS18Q9P253 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS18Q9P253 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS18Q9P253 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS18Q9P253 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS18Q9P253 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS18Q9P253 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS18Q9P253 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS18Q9P253 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms