Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI8

IGF2BP1, Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2BP1Q9NZI8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 47.1
IGF2BP1Q9NZI8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 47.1
IGF2BP1Q9NZI8 RAB6A-208ENST00000541795 1812 ntTSL 217.79■□□□□ 0.448e-7■■■■■ 47.1
IGF2BP1Q9NZI8 BIRC2-212ENST00000534646 562 ntTSL 418.86■□□□□ 0.612e-15■■■■■ 47
IGF2BP1Q9NZI8 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.727e-8■■■■■ 47
IGF2BP1Q9NZI8 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.787e-8■■■■■ 47
IGF2BP1Q9NZI8 PAPD4-211ENST00000508620 483 ntTSL 416.14■□□□□ 0.175e-19■■■■■ 46.8
IGF2BP1Q9NZI8 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.054e-14■■■■■ 46.6
IGF2BP1Q9NZI8 CCT3-206ENST00000368262 2048 ntTSL 213.83□□□□□ -0.24e-14■■■■■ 46.6
IGF2BP1Q9NZI8 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.294e-14■■■■■ 46.6
IGF2BP1Q9NZI8 LAMP1-202ENST00000471046 424 ntTSL 312.27□□□□□ -0.454e-14■■■■■ 46.6
IGF2BP1Q9NZI8 CCT3-203ENST00000368258 1885 ntTSL 212.21□□□□□ -0.454e-14■■■■■ 46.6
IGF2BP1Q9NZI8 CCT3-205ENST00000368261 863 ntTSL 510.96□□□□□ -0.654e-14■■■■■ 46.6
IGF2BP1Q9NZI8 SP3-204ENST00000462904 535 ntTSL 49.97□□□□□ -0.811e-8■■■■■ 46.5
IGF2BP1Q9NZI8 MBNL3-207ENST00000421707 946 ntTSL 512.38□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 46.4
IGF2BP1Q9NZI8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.021e-37■■■■■ 46.4
IGF2BP1Q9NZI8 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.171e-37■■■■■ 46.4
IGF2BP1Q9NZI8 ADAT2-201ENST00000237283 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.698e-14■■■■■ 45.8
IGF2BP1Q9NZI8 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.818e-14■■■■■ 45.8
IGF2BP1Q9NZI8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.751e-20■■■■■ 45.7
IGF2BP1Q9NZI8 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.091e-20■■■■■ 45.7
IGF2BP1Q9NZI8 GTF2A2-210ENST00000559706 382 ntTSL 213.96□□□□□ -0.171e-20■■■■■ 45.7
IGF2BP1Q9NZI8 GTF2A2-209ENST00000559141 293 ntTSL 512.3□□□□□ -0.441e-20■■■■■ 45.7
IGF2BP1Q9NZI8 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.531e-20■■■■■ 45.7
IGF2BP1Q9NZI8 MBNL3-209ENST00000442191 840 ntTSL 28.27□□□□□ -1.093e-8■■■■■ 45.7
IGF2BP1Q9NZI8 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.063e-14■■■■■ 45.6
IGF2BP1Q9NZI8 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.253e-14■■■■■ 45.6
IGF2BP1Q9NZI8 ASNS-210ENST00000448127 579 ntTSL 29.19□□□□□ -0.944e-9■■■■■ 45.4
IGF2BP1Q9NZI8 RIF1-207ENST00000454583 3552 ntTSL 24.89□□□□□ -1.639e-9■■■■■ 45.3
IGF2BP1Q9NZI8 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.677e-14■■■■■ 45.3
IGF2BP1Q9NZI8 EIF3H-212ENST00000611080 1265 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.963e-7■■■■■ 45.1
IGF2BP1Q9NZI8 EIF3H-201ENST00000276682 2041 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.063e-7■■■■■ 45.1
IGF2BP1Q9NZI8 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.523e-7■■■■■ 45.1
IGF2BP1Q9NZI8 NQO1-201ENST00000320623 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 45.1
IGF2BP1Q9NZI8 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 45.1
IGF2BP1Q9NZI8 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.31e-7■■■■■ 45.1
IGF2BP1Q9NZI8 ST6GAL1-214ENST00000455441 596 ntTSL 420.22■□□□□ 0.833e-9■■■■■ 45
IGF2BP1Q9NZI8 ST6GAL1-205ENST00000427315 544 ntTSL 420.13■□□□□ 0.813e-9■■■■■ 45
IGF2BP1Q9NZI8 ST6GAL1-222ENST00000487031 592 ntTSL 419.86■□□□□ 0.773e-9■■■■■ 45
IGF2BP1Q9NZI8 ST6GAL1-217ENST00000463542 516 ntTSL 419.01■□□□□ 0.633e-9■■■■■ 45
IGF2BP1Q9NZI8 ST6GAL1-216ENST00000458216 507 ntTSL 312.86□□□□□ -0.353e-9■■■■■ 45
IGF2BP1Q9NZI8 ST6GAL1-219ENST00000468614 642 ntTSL 211.34□□□□□ -0.593e-9■■■■■ 45
IGF2BP1Q9NZI8 ST6GAL1-206ENST00000430309 504 ntTSL 48.73□□□□□ -1.013e-9■■■■■ 45
IGF2BP1Q9NZI8 ST6GAL1-203ENST00000417392 707 ntTSL 28.12□□□□□ -1.113e-9■■■■■ 45
IGF2BP1Q9NZI8 TFG-207ENST00000487505 913 ntTSL 318.62■□□□□ 0.572e-8■■■■■ 45
IGF2BP1Q9NZI8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.045e-14■■■■■ 44.9
IGF2BP1Q9NZI8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.445e-14■■■■■ 44.9
IGF2BP1Q9NZI8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.35e-14■■■■■ 44.9
IGF2BP1Q9NZI8 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.045e-14■■■■■ 44.9
IGF2BP1Q9NZI8 CDK2AP1-204ENST00000538446 1161 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.375e-14■■■■■ 44.9
IGF2BP1Q9NZI8 CDK2AP1-206ENST00000544658 931 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.95e-14■■■■■ 44.9
IGF2BP1Q9NZI8 SLC39A8-206ENST00000512337 251 ntTSL 38.38□□□□□ -1.072e-14■■■■■ 44.8
IGF2BP1Q9NZI8 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.34e-10■■■■■ 44.8
IGF2BP1Q9NZI8 SQLE-203ENST00000518931 554 ntTSL 47.9□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 44.7
IGF2BP1Q9NZI8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.085e-11■■■■■ 44.4
IGF2BP1Q9NZI8 RFK-206ENST00000490113 2386 ntTSL 29.47□□□□□ -0.895e-11■■■■■ 44.4
IGF2BP1Q9NZI8 RELN-205ENST00000473457 641 ntTSL 38.98□□□□□ -0.973e-12■■■■■ 44.4
IGF2BP1Q9NZI8 PSMA1-213ENST00000533068 571 ntTSL 413.89□□□□□ -0.196e-8■■■■■ 44.4
IGF2BP1Q9NZI8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.811e-13■■■■■ 44.2
IGF2BP1Q9NZI8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.267e-38■■■■■ 44.1
IGF2BP1Q9NZI8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.267e-38■■■■■ 44.1
IGF2BP1Q9NZI8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.167e-38■■■■■ 44.1
IGF2BP1Q9NZI8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.087e-38■■■■■ 44.1
IGF2BP1Q9NZI8 ELOF1-207ENST00000591674 679 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.057e-38■■■■■ 44.1
IGF2BP1Q9NZI8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.982e-7■■■■■ 44.1
IGF2BP1Q9NZI8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.832e-7■■■■■ 44.1
IGF2BP1Q9NZI8 GRINA-204ENST00000527194 806 ntTSL 214.68□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 44.1
IGF2BP1Q9NZI8 TNPO1-213ENST00000523768 2632 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.63e-14■■■■■ 43.7
IGF2BP1Q9NZI8 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.233e-14■■■■■ 43.7
IGF2BP1Q9NZI8 TNPO1-214ENST00000605210 752 ntTSL 26.88□□□□□ -1.313e-14■■■■■ 43.7
IGF2BP1Q9NZI8 EIF3L-205ENST00000436452 574 ntTSL 46.35□□□□□ -1.393e-7■■■■■ 43.7
IGF2BP1Q9NZI8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.091e-7■■■■■ 43.6
IGF2BP1Q9NZI8 EIF3E-214ENST00000522352 611 ntTSL 37.12□□□□□ -1.277e-8■■■■■ 43.6
IGF2BP1Q9NZI8 BAG4-203ENST00000521282 530 ntTSL 218.73■□□□□ 0.591e-8■■■■■ 43.5
IGF2BP1Q9NZI8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.324e-9■■■■■ 43.4
IGF2BP1Q9NZI8 PFKP-207ENST00000421751 658 ntTSL 415.56■□□□□ 0.084e-9■■■■■ 43.4
IGF2BP1Q9NZI8 PFKP-204ENST00000407806 705 ntTSL 514.04□□□□□ -0.164e-9■■■■■ 43.4
IGF2BP1Q9NZI8 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.214e-9■■■■■ 43.4
IGF2BP1Q9NZI8 PFKP-212ENST00000607886 432 ntTSL 513.4□□□□□ -0.264e-9■■■■■ 43.4
IGF2BP1Q9NZI8 GTF2A2-201ENST00000267869 518 ntTSL 314.69□□□□□ -0.066e-10■■■■■ 43.4
IGF2BP1Q9NZI8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.076e-10■■■■■ 43.4
IGF2BP1Q9NZI8 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.096e-10■■■■■ 43.4
IGF2BP1Q9NZI8 GTF2A2-202ENST00000396060 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.496e-10■■■■■ 43.4
IGF2BP1Q9NZI8 PIM1-203ENST00000479509 675 ntTSL 212.64□□□□□ -0.393e-20■■■■■ 43.4
IGF2BP1Q9NZI8 ASNS-208ENST00000442734 828 ntTSL 215.84■□□□□ 0.136e-8■■■■■ 43.3
IGF2BP1Q9NZI8 ASNS-207ENST00000437657 745 ntTSL 56.85□□□□□ -1.316e-8■■■■■ 43.3
IGF2BP1Q9NZI8 ASNS-211ENST00000451771 562 ntTSL 218.61■□□□□ 0.574e-9■■■■■ 43.2
IGF2BP1Q9NZI8 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.271e-20■■■■■ 43.2
IGF2BP1Q9NZI8 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.221e-9■■■■■ 43.2
IGF2BP1Q9NZI8 NACA-205ENST00000546410 600 ntTSL 25.68□□□□□ -1.51e-19■■■■■ 42.9
IGF2BP1Q9NZI8 MBNL3-208ENST00000436215 891 ntTSL 35.36□□□□□ -1.552e-8■■■■■ 42.7
IGF2BP1Q9NZI8 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.232e-10■■■■■ 42.7
IGF2BP1Q9NZI8 CHD1-209ENST00000512844 848 ntTSL 58.03□□□□□ -1.122e-10■■■■■ 42.7
IGF2BP1Q9NZI8 CHD1-208ENST00000512392 1968 ntTSL 26.21□□□□□ -1.422e-10■■■■■ 42.7
IGF2BP1Q9NZI8 CHD1-211ENST00000514344 2955 ntTSL 53.03□□□□□ -1.922e-10■■■■■ 42.7
IGF2BP1Q9NZI8 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.942e-10■■■■■ 42.7
IGF2BP1Q9NZI8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.639e-9■■■■■ 42.6
IGF2BP1Q9NZI8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.419e-9■■■■■ 42.6
IGF2BP1Q9NZI8 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.189e-9■■■■■ 42.6
IGF2BP1Q9NZI8 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.019e-9■■■■■ 42.6
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