Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ09

UBAP1, Ubiquitin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1Q9NZ09 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBAP1Q9NZ09 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBAP1Q9NZ09 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBAP1Q9NZ09 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBAP1Q9NZ09 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBAP1Q9NZ09 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBAP1Q9NZ09 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBAP1Q9NZ09 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBAP1Q9NZ09 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBAP1Q9NZ09 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBAP1Q9NZ09 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBAP1Q9NZ09 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBAP1Q9NZ09 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBAP1Q9NZ09 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBAP1Q9NZ09 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBAP1Q9NZ09 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBAP1Q9NZ09 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBAP1Q9NZ09 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBAP1Q9NZ09 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBAP1Q9NZ09 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBAP1Q9NZ09 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBAP1Q9NZ09 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBAP1Q9NZ09 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UBAP1Q9NZ09 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBAP1Q9NZ09 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBAP1Q9NZ09 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBAP1Q9NZ09 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBAP1Q9NZ09 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBAP1Q9NZ09 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBAP1Q9NZ09 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBAP1Q9NZ09 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBAP1Q9NZ09 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBAP1Q9NZ09 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBAP1Q9NZ09 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBAP1Q9NZ09 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBAP1Q9NZ09 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBAP1Q9NZ09 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBAP1Q9NZ09 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBAP1Q9NZ09 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBAP1Q9NZ09 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBAP1Q9NZ09 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBAP1Q9NZ09 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBAP1Q9NZ09 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBAP1Q9NZ09 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBAP1Q9NZ09 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBAP1Q9NZ09 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBAP1Q9NZ09 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBAP1Q9NZ09 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBAP1Q9NZ09 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBAP1Q9NZ09 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBAP1Q9NZ09 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBAP1Q9NZ09 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBAP1Q9NZ09 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
UBAP1Q9NZ09 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
UBAP1Q9NZ09 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBAP1Q9NZ09 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBAP1Q9NZ09 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBAP1Q9NZ09 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBAP1Q9NZ09 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBAP1Q9NZ09 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBAP1Q9NZ09 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBAP1Q9NZ09 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBAP1Q9NZ09 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBAP1Q9NZ09 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBAP1Q9NZ09 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBAP1Q9NZ09 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBAP1Q9NZ09 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBAP1Q9NZ09 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBAP1Q9NZ09 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBAP1Q9NZ09 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBAP1Q9NZ09 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBAP1Q9NZ09 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBAP1Q9NZ09 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBAP1Q9NZ09 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBAP1Q9NZ09 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBAP1Q9NZ09 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBAP1Q9NZ09 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBAP1Q9NZ09 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBAP1Q9NZ09 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBAP1Q9NZ09 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBAP1Q9NZ09 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBAP1Q9NZ09 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBAP1Q9NZ09 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBAP1Q9NZ09 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBAP1Q9NZ09 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBAP1Q9NZ09 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBAP1Q9NZ09 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UBAP1Q9NZ09 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBAP1Q9NZ09 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBAP1Q9NZ09 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBAP1Q9NZ09 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBAP1Q9NZ09 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBAP1Q9NZ09 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBAP1Q9NZ09 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBAP1Q9NZ09 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBAP1Q9NZ09 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBAP1Q9NZ09 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBAP1Q9NZ09 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBAP1Q9NZ09 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBAP1Q9NZ09 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms