Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ING3Q9NXR8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ING3Q9NXR8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ING3Q9NXR8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ING3Q9NXR8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ING3Q9NXR8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ING3Q9NXR8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ING3Q9NXR8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ING3Q9NXR8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ING3Q9NXR8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ING3Q9NXR8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ING3Q9NXR8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ING3Q9NXR8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ING3Q9NXR8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ING3Q9NXR8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ING3Q9NXR8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ING3Q9NXR8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ING3Q9NXR8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ING3Q9NXR8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ING3Q9NXR8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ING3Q9NXR8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ING3Q9NXR8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ING3Q9NXR8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ING3Q9NXR8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ING3Q9NXR8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ING3Q9NXR8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ING3Q9NXR8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ING3Q9NXR8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ING3Q9NXR8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ING3Q9NXR8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ING3Q9NXR8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ING3Q9NXR8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ING3Q9NXR8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ING3Q9NXR8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ING3Q9NXR8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ING3Q9NXR8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ING3Q9NXR8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ING3Q9NXR8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ING3Q9NXR8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ING3Q9NXR8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ING3Q9NXR8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ING3Q9NXR8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ING3Q9NXR8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ING3Q9NXR8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ING3Q9NXR8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ING3Q9NXR8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ING3Q9NXR8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ING3Q9NXR8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ING3Q9NXR8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ING3Q9NXR8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ING3Q9NXR8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ING3Q9NXR8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ING3Q9NXR8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ING3Q9NXR8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ING3Q9NXR8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ING3Q9NXR8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ING3Q9NXR8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ING3Q9NXR8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ING3Q9NXR8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ING3Q9NXR8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ING3Q9NXR8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ING3Q9NXR8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ING3Q9NXR8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ING3Q9NXR8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ING3Q9NXR8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ING3Q9NXR8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ING3Q9NXR8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ING3Q9NXR8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ING3Q9NXR8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ING3Q9NXR8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ING3Q9NXR8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ING3Q9NXR8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ING3Q9NXR8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ING3Q9NXR8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ING3Q9NXR8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ING3Q9NXR8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ING3Q9NXR8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ING3Q9NXR8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ING3Q9NXR8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ING3Q9NXR8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ING3Q9NXR8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ING3Q9NXR8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ING3Q9NXR8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ING3Q9NXR8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ING3Q9NXR8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ING3Q9NXR8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ING3Q9NXR8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ING3Q9NXR8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ING3Q9NXR8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ING3Q9NXR8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ING3Q9NXR8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ING3Q9NXR8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ING3Q9NXR8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ING3Q9NXR8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ING3Q9NXR8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ING3Q9NXR8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ING3Q9NXR8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ING3Q9NXR8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ING3Q9NXR8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ING3Q9NXR8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms