Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 APBB2-201ENST00000295974 8972 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.746e-14■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 APBB2-224ENST00000513140 4166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.096e-14■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 APBB2-229ENST00000514920 550 ntTSL 48.22□□□□□ -1.096e-14■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 APBB2-227ENST00000513611 2964 ntTSL 57.89□□□□□ -1.156e-14■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.436e-14■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 APBB2-220ENST00000510925 701 ntTSL 33.6□□□□□ -1.836e-14■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 MCM7-209ENST00000485286 2900 ntTSL 217.28■□□□□ 0.367e-18■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.247e-18■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.087e-18■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 MCM7-212ENST00000493352 533 ntTSL 213.26□□□□□ -0.297e-18■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.367e-18■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.457e-18■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 MCM7-210ENST00000489841 2515 ntTSL 1 (best)10.03□□□□□ -0.87e-18■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 MCM7-211ENST00000491245 648 ntTSL 1 (best)9.03□□□□□ -0.967e-18■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.051e-10■■■■■ 64.2
RBM22Q9NW64 LRIG2-205ENST00000492207 5076 ntTSL 55.95□□□□□ -1.461e-10■■■■■ 64.2
RBM22Q9NW64 UBAC1-204ENST00000478485 773 ntTSL 224.24■■□□□ 1.475e-15■■■■■ 64
RBM22Q9NW64 UBAC1-205ENST00000486258 243 ntTSL 39.03□□□□□ -0.965e-15■■■■■ 64
RBM22Q9NW64 ANAPC5-209ENST00000535641 2627 ntTSL 211.69□□□□□ -0.542e-10■■■■■ 63.5
RBM22Q9NW64 ANAPC5-214ENST00000539079 1715 ntTSL 1 (best)9.32□□□□□ -0.922e-10■■■■■ 63.5
RBM22Q9NW64 ANAPC5-207ENST00000535472 1048 ntTSL 59.11□□□□□ -0.952e-10■■■■■ 63.5
RBM22Q9NW64 ANAPC5-219ENST00000544314 1508 ntTSL 29.06□□□□□ -0.962e-10■■■■■ 63.5
RBM22Q9NW64 ANAPC5-221ENST00000545218 1328 ntTSL 58.28□□□□□ -1.082e-10■■■■■ 63.5
RBM22Q9NW64 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.177e-12■■■■■ 63.3
RBM22Q9NW64 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.157e-12■■■■■ 63.3
RBM22Q9NW64 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.227e-12■■■■■ 63.3
RBM22Q9NW64 PPP6C-202ENST00000415905 4172 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.357e-12■■■■■ 63.3
RBM22Q9NW64 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.167e-12■■■■■ 63.3
RBM22Q9NW64 PPP6C-204ENST00000456642 569 ntTSL 36.09□□□□□ -1.437e-12■■■■■ 63.3
RBM22Q9NW64 SMC5-203ENST00000475540 688 ntTSL 33.41□□□□□ -1.867e-12■■■■■ 63.3
RBM22Q9NW64 TIA1-207ENST00000454815 911 ntTSL 52.64□□□□□ -1.997e-12■■■■■ 63.3
RBM22Q9NW64 TIA1-202ENST00000361692 543 ntTSL 50.99□□□□□ -2.257e-12■■■■■ 63.3
RBM22Q9NW64 GABRE-207ENST00000476016 813 ntTSL 48.29□□□□□ -1.083e-11■■■■■ 61.7
RBM22Q9NW64 GABRE-206ENST00000474932 430 ntTSL 52.35□□□□□ -2.033e-11■■■■■ 61.7
RBM22Q9NW64 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.118e-10■■■■■ 61.7
RBM22Q9NW64 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.048e-10■■■■■ 61.7
RBM22Q9NW64 TMEM2-210ENST00000542935 5372 ntTSL 1 (best)7.28□□□□□ -1.248e-10■■■■■ 61.7
RBM22Q9NW64 TMEM2-203ENST00000377055 722 ntTSL 36.93□□□□□ -1.38e-10■■■■■ 61.7
RBM22Q9NW64 TMEM2-201ENST00000377043 675 ntTSL 25.04□□□□□ -1.68e-10■■■■■ 61.7
RBM22Q9NW64 TMEM2-208ENST00000537329 581 ntTSL 22.32□□□□□ -2.048e-10■■■■■ 61.7
RBM22Q9NW64 CDK1-206ENST00000487784 598 ntTSL 51.21□□□□□ -2.229e-15■■■■■ 61.5
RBM22Q9NW64 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.092e-11■■■■■ 61.3
RBM22Q9NW64 NOP58-209ENST00000492688 571 ntTSL 43.62□□□□□ -1.832e-11■■■■■ 61.3
RBM22Q9NW64 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.696e-13■■■■■ 61.1
RBM22Q9NW64 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.576e-13■■■■■ 61.1
RBM22Q9NW64 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.496e-13■■■■■ 61.1
RBM22Q9NW64 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.366e-13■■■■■ 61.1
RBM22Q9NW64 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.366e-13■■■■■ 61.1
RBM22Q9NW64 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.326e-13■■■■■ 61.1
RBM22Q9NW64 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.266e-13■■■■■ 61.1
RBM22Q9NW64 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.16e-13■■■■■ 61.1
RBM22Q9NW64 EWSR1-212ENST00000444626 560 ntTSL 514.05□□□□□ -0.166e-13■■■■■ 61.1
RBM22Q9NW64 EWSR1-213ENST00000447973 582 ntTSL 413.58□□□□□ -0.246e-13■■■■■ 61.1
RBM22Q9NW64 EWSR1-210ENST00000436425 553 ntTSL 413.32□□□□□ -0.286e-13■■■■■ 61.1
RBM22Q9NW64 EWSR1-217ENST00000483415 3231 ntTSL 1 (best)10.69□□□□□ -0.76e-13■■■■■ 61.1
RBM22Q9NW64 EWSR1-211ENST00000437155 933 ntTSL 59.46□□□□□ -0.96e-13■■■■■ 61.1
RBM22Q9NW64 EWSR1-214ENST00000455726 710 ntTSL 37.22□□□□□ -1.256e-13■■■■■ 61.1
RBM22Q9NW64 EWSR1-219ENST00000485037 479 ntTSL 55.66□□□□□ -1.56e-13■■■■■ 61.1
RBM22Q9NW64 EWSR1-209ENST00000415761 587 ntTSL 33.18□□□□□ -1.96e-13■■■■■ 61.1
RBM22Q9NW64 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.321e-8■■■■■ 61
RBM22Q9NW64 SLC25A13-201ENST00000265631 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.931e-8■■■■■ 61
RBM22Q9NW64 SLC25A13-204ENST00000484495 540 ntTSL 59.07□□□□□ -0.961e-8■■■■■ 61
RBM22Q9NW64 TF-207ENST00000467842 4602 ntTSL 1 (best)6.93□□□□□ -1.31e-323■■■■■ 60.8
RBM22Q9NW64 UBR4-207ENST00000425413 2954 ntTSL 211.78□□□□□ -0.522e-15■■■■■ 60.6
RBM22Q9NW64 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.291e-15■■■■■ 60.3
RBM22Q9NW64 PLXND1-216ENST00000514990 1084 ntTSL 211.9□□□□□ -0.51e-15■■■■■ 60.3
RBM22Q9NW64 ARAP1-208ENST00000452383 994 ntTSL 314.84□□□□□ -0.033e-8■■■■■ 60.2
RBM22Q9NW64 ARAP1-206ENST00000427971 1101 ntTSL 512.89□□□□□ -0.353e-8■■■■■ 60.2
RBM22Q9NW64 RPLP2-202ENST00000524867 598 ntTSL 225.47■■□□□ 1.673e-11■■■■■ 60.1
RBM22Q9NW64 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.583e-11■■■■■ 60.1
RBM22Q9NW64 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.143e-11■■■■■ 60.1
RBM22Q9NW64 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 13e-11■■■■■ 60.1
RBM22Q9NW64 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.543e-11■■■■■ 60.1
RBM22Q9NW64 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.293e-11■■■■■ 60.1
RBM22Q9NW64 TOP1MT-210ENST00000519977 892 ntTSL 316.3■□□□□ 0.23e-11■■■■■ 60.1
RBM22Q9NW64 RPLP2-208ENST00000532004 353 ntTSL 315.54■□□□□ 0.083e-11■■■■■ 60.1
RBM22Q9NW64 TOP1MT-203ENST00000517857 624 ntTSL 214.71□□□□□ -0.053e-11■■■■■ 60.1
RBM22Q9NW64 TOP1MT-213ENST00000521193 1960 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.283e-11■■■■■ 60.1
RBM22Q9NW64 RPLP2-206ENST00000530398 313 ntTSL 311.81□□□□□ -0.523e-11■■■■■ 60.1
RBM22Q9NW64 RPLP2-204ENST00000526222 350 ntTSL 211.19□□□□□ -0.623e-11■■■■■ 60.1
RBM22Q9NW64 TAF1D-206ENST00000527068 1023 ntTSL 52.68□□□□□ -1.983e-12■■■■■ 60
RBM22Q9NW64 TAF1D-212ENST00000529794 1123 ntTSL 22.07□□□□□ -2.083e-12■■■■■ 60
RBM22Q9NW64 MAU2-211ENST00000589947 670 ntTSL 413.39□□□□□ -0.272e-11■■■■■ 60
RBM22Q9NW64 MAU2-208ENST00000587709 3751 ntTSL 210.39□□□□□ -0.752e-11■■■■■ 60
RBM22Q9NW64 MAU2-213ENST00000590882 553 ntTSL 48.31□□□□□ -1.082e-11■■■■■ 60
RBM22Q9NW64 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.162e-14■■■■■ 59.7
RBM22Q9NW64 STRBP-203ENST00000407982 2751 ntTSL 1 (best)20.9■□□□□ 0.942e-14■■■■■ 59.7
RBM22Q9NW64 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.662e-14■■■■■ 59.7
RBM22Q9NW64 KIAA0907-206ENST00000466713 911 ntTSL 1 (best)15.69■□□□□ 0.12e-14■■■■■ 59.7
RBM22Q9NW64 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.242e-14■■■■■ 59.7
RBM22Q9NW64 CEP83-201ENST00000339839 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.382e-14■■■■■ 59.7
RBM22Q9NW64 CEP83-207ENST00000547232 2166 ntTSL 1 (best)12.47□□□□□ -0.412e-14■■■■■ 59.7
RBM22Q9NW64 CEP83-203ENST00000397809 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.452e-14■■■■■ 59.7
RBM22Q9NW64 CEP83-211ENST00000551078 565 ntTSL 411.54□□□□□ -0.562e-14■■■■■ 59.7
RBM22Q9NW64 TNRC6A-203ENST00000450465 3700 ntTSL 28.45□□□□□ -1.062e-14■■■■■ 59.7
RBM22Q9NW64 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.182e-14■■■■■ 59.7
RBM22Q9NW64 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.242e-14■■■■■ 59.7
RBM22Q9NW64 TNRC6A-207ENST00000491718 7956 ntTSL 1 (best)6.38□□□□□ -1.392e-14■■■■■ 59.7
RBM22Q9NW64 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.452e-14■■■■■ 59.7
RBM22Q9NW64 CEP83-209ENST00000549352 861 ntTSL 1 (best)3.92□□□□□ -1.782e-14■■■■■ 59.7
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