Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACER3Q9NUN7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACER3Q9NUN7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACER3Q9NUN7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACER3Q9NUN7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACER3Q9NUN7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACER3Q9NUN7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACER3Q9NUN7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACER3Q9NUN7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACER3Q9NUN7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACER3Q9NUN7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACER3Q9NUN7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACER3Q9NUN7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACER3Q9NUN7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACER3Q9NUN7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACER3Q9NUN7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACER3Q9NUN7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACER3Q9NUN7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACER3Q9NUN7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACER3Q9NUN7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACER3Q9NUN7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACER3Q9NUN7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACER3Q9NUN7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ACER3Q9NUN7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACER3Q9NUN7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ACER3Q9NUN7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACER3Q9NUN7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACER3Q9NUN7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACER3Q9NUN7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACER3Q9NUN7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACER3Q9NUN7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACER3Q9NUN7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACER3Q9NUN7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACER3Q9NUN7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACER3Q9NUN7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACER3Q9NUN7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACER3Q9NUN7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACER3Q9NUN7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACER3Q9NUN7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACER3Q9NUN7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACER3Q9NUN7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACER3Q9NUN7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACER3Q9NUN7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACER3Q9NUN7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACER3Q9NUN7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACER3Q9NUN7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACER3Q9NUN7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACER3Q9NUN7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ACER3Q9NUN7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACER3Q9NUN7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ACER3Q9NUN7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACER3Q9NUN7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACER3Q9NUN7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACER3Q9NUN7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACER3Q9NUN7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACER3Q9NUN7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACER3Q9NUN7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACER3Q9NUN7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACER3Q9NUN7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACER3Q9NUN7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACER3Q9NUN7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACER3Q9NUN7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACER3Q9NUN7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACER3Q9NUN7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACER3Q9NUN7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACER3Q9NUN7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACER3Q9NUN7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACER3Q9NUN7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ACER3Q9NUN7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACER3Q9NUN7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACER3Q9NUN7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACER3Q9NUN7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACER3Q9NUN7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACER3Q9NUN7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACER3Q9NUN7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACER3Q9NUN7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACER3Q9NUN7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACER3Q9NUN7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACER3Q9NUN7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACER3Q9NUN7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACER3Q9NUN7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACER3Q9NUN7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACER3Q9NUN7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACER3Q9NUN7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACER3Q9NUN7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACER3Q9NUN7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACER3Q9NUN7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACER3Q9NUN7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACER3Q9NUN7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACER3Q9NUN7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACER3Q9NUN7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACER3Q9NUN7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ACER3Q9NUN7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACER3Q9NUN7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ACER3Q9NUN7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACER3Q9NUN7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACER3Q9NUN7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACER3Q9NUN7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACER3Q9NUN7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACER3Q9NUN7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms