Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPMQ9NSP4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPMQ9NSP4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPMQ9NSP4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPMQ9NSP4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPMQ9NSP4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPMQ9NSP4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPMQ9NSP4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPMQ9NSP4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPMQ9NSP4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPMQ9NSP4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPMQ9NSP4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPMQ9NSP4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPMQ9NSP4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPMQ9NSP4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPMQ9NSP4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPMQ9NSP4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPMQ9NSP4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPMQ9NSP4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPMQ9NSP4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPMQ9NSP4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPMQ9NSP4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPMQ9NSP4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPMQ9NSP4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPMQ9NSP4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPMQ9NSP4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPMQ9NSP4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPMQ9NSP4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPMQ9NSP4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPMQ9NSP4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPMQ9NSP4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPMQ9NSP4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPMQ9NSP4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPMQ9NSP4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPMQ9NSP4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPMQ9NSP4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPMQ9NSP4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPMQ9NSP4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPMQ9NSP4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPMQ9NSP4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPMQ9NSP4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPMQ9NSP4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPMQ9NSP4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPMQ9NSP4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPMQ9NSP4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPMQ9NSP4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPMQ9NSP4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPMQ9NSP4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPMQ9NSP4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPMQ9NSP4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPMQ9NSP4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPMQ9NSP4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPMQ9NSP4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPMQ9NSP4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPMQ9NSP4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPMQ9NSP4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPMQ9NSP4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPMQ9NSP4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPMQ9NSP4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPMQ9NSP4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPMQ9NSP4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPMQ9NSP4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPMQ9NSP4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPMQ9NSP4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPMQ9NSP4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPMQ9NSP4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPMQ9NSP4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPMQ9NSP4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPMQ9NSP4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPMQ9NSP4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPMQ9NSP4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPMQ9NSP4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPMQ9NSP4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPMQ9NSP4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPMQ9NSP4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPMQ9NSP4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPMQ9NSP4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPMQ9NSP4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPMQ9NSP4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPMQ9NSP4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPMQ9NSP4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPMQ9NSP4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPMQ9NSP4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPMQ9NSP4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPMQ9NSP4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPMQ9NSP4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPMQ9NSP4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPMQ9NSP4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPMQ9NSP4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPMQ9NSP4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPMQ9NSP4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPMQ9NSP4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPMQ9NSP4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPMQ9NSP4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPMQ9NSP4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPMQ9NSP4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPMQ9NSP4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPMQ9NSP4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPMQ9NSP4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPMQ9NSP4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms