Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY6

PLSCR3, Phospholipid scramblase 3, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLSCR3Q9NRY6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLSCR3Q9NRY6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PLSCR3Q9NRY6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLSCR3Q9NRY6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLSCR3Q9NRY6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLSCR3Q9NRY6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLSCR3Q9NRY6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLSCR3Q9NRY6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLSCR3Q9NRY6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLSCR3Q9NRY6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PLSCR3Q9NRY6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLSCR3Q9NRY6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLSCR3Q9NRY6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLSCR3Q9NRY6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLSCR3Q9NRY6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLSCR3Q9NRY6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLSCR3Q9NRY6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLSCR3Q9NRY6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLSCR3Q9NRY6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLSCR3Q9NRY6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLSCR3Q9NRY6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLSCR3Q9NRY6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLSCR3Q9NRY6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PLSCR3Q9NRY6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLSCR3Q9NRY6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLSCR3Q9NRY6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLSCR3Q9NRY6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLSCR3Q9NRY6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLSCR3Q9NRY6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLSCR3Q9NRY6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLSCR3Q9NRY6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLSCR3Q9NRY6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLSCR3Q9NRY6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLSCR3Q9NRY6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLSCR3Q9NRY6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLSCR3Q9NRY6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLSCR3Q9NRY6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PLSCR3Q9NRY6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLSCR3Q9NRY6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLSCR3Q9NRY6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLSCR3Q9NRY6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLSCR3Q9NRY6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLSCR3Q9NRY6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLSCR3Q9NRY6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLSCR3Q9NRY6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLSCR3Q9NRY6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLSCR3Q9NRY6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLSCR3Q9NRY6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLSCR3Q9NRY6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLSCR3Q9NRY6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLSCR3Q9NRY6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLSCR3Q9NRY6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLSCR3Q9NRY6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLSCR3Q9NRY6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLSCR3Q9NRY6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLSCR3Q9NRY6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLSCR3Q9NRY6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLSCR3Q9NRY6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLSCR3Q9NRY6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLSCR3Q9NRY6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLSCR3Q9NRY6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLSCR3Q9NRY6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLSCR3Q9NRY6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLSCR3Q9NRY6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLSCR3Q9NRY6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLSCR3Q9NRY6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLSCR3Q9NRY6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLSCR3Q9NRY6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLSCR3Q9NRY6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLSCR3Q9NRY6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLSCR3Q9NRY6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLSCR3Q9NRY6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLSCR3Q9NRY6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLSCR3Q9NRY6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLSCR3Q9NRY6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLSCR3Q9NRY6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLSCR3Q9NRY6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLSCR3Q9NRY6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLSCR3Q9NRY6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PLSCR3Q9NRY6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLSCR3Q9NRY6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLSCR3Q9NRY6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLSCR3Q9NRY6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLSCR3Q9NRY6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLSCR3Q9NRY6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLSCR3Q9NRY6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLSCR3Q9NRY6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLSCR3Q9NRY6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLSCR3Q9NRY6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PLSCR3Q9NRY6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLSCR3Q9NRY6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLSCR3Q9NRY6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLSCR3Q9NRY6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLSCR3Q9NRY6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLSCR3Q9NRY6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLSCR3Q9NRY6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLSCR3Q9NRY6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLSCR3Q9NRY6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLSCR3Q9NRY6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLSCR3Q9NRY6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms