Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TIMMDC1Q9NPL8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIMMDC1Q9NPL8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TIMMDC1Q9NPL8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TIMMDC1Q9NPL8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TIMMDC1Q9NPL8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TIMMDC1Q9NPL8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TIMMDC1Q9NPL8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TIMMDC1Q9NPL8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TIMMDC1Q9NPL8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TIMMDC1Q9NPL8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TIMMDC1Q9NPL8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TIMMDC1Q9NPL8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TIMMDC1Q9NPL8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TIMMDC1Q9NPL8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TIMMDC1Q9NPL8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TIMMDC1Q9NPL8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TIMMDC1Q9NPL8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TIMMDC1Q9NPL8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TIMMDC1Q9NPL8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TIMMDC1Q9NPL8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TIMMDC1Q9NPL8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TIMMDC1Q9NPL8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TIMMDC1Q9NPL8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TIMMDC1Q9NPL8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TIMMDC1Q9NPL8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TIMMDC1Q9NPL8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TIMMDC1Q9NPL8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TIMMDC1Q9NPL8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TIMMDC1Q9NPL8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TIMMDC1Q9NPL8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TIMMDC1Q9NPL8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TIMMDC1Q9NPL8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TIMMDC1Q9NPL8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TIMMDC1Q9NPL8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TIMMDC1Q9NPL8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TIMMDC1Q9NPL8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIMMDC1Q9NPL8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TIMMDC1Q9NPL8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIMMDC1Q9NPL8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIMMDC1Q9NPL8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TIMMDC1Q9NPL8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TIMMDC1Q9NPL8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TIMMDC1Q9NPL8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIMMDC1Q9NPL8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIMMDC1Q9NPL8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIMMDC1Q9NPL8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIMMDC1Q9NPL8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIMMDC1Q9NPL8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TIMMDC1Q9NPL8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TIMMDC1Q9NPL8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TIMMDC1Q9NPL8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TIMMDC1Q9NPL8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TIMMDC1Q9NPL8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TIMMDC1Q9NPL8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TIMMDC1Q9NPL8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TIMMDC1Q9NPL8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TIMMDC1Q9NPL8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TIMMDC1Q9NPL8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TIMMDC1Q9NPL8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TIMMDC1Q9NPL8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TIMMDC1Q9NPL8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TIMMDC1Q9NPL8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TIMMDC1Q9NPL8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TIMMDC1Q9NPL8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMMDC1Q9NPL8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMMDC1Q9NPL8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMMDC1Q9NPL8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TIMMDC1Q9NPL8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TIMMDC1Q9NPL8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TIMMDC1Q9NPL8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TIMMDC1Q9NPL8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMMDC1Q9NPL8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMMDC1Q9NPL8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMMDC1Q9NPL8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TIMMDC1Q9NPL8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TIMMDC1Q9NPL8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TIMMDC1Q9NPL8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TIMMDC1Q9NPL8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMMDC1Q9NPL8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TIMMDC1Q9NPL8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMMDC1Q9NPL8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMMDC1Q9NPL8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMMDC1Q9NPL8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TIMMDC1Q9NPL8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TIMMDC1Q9NPL8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TIMMDC1Q9NPL8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TIMMDC1Q9NPL8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms