Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLCO1B3Q9NPD5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SLCO1B3Q9NPD5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLCO1B3Q9NPD5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLCO1B3Q9NPD5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLCO1B3Q9NPD5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLCO1B3Q9NPD5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLCO1B3Q9NPD5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLCO1B3Q9NPD5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLCO1B3Q9NPD5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLCO1B3Q9NPD5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLCO1B3Q9NPD5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLCO1B3Q9NPD5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLCO1B3Q9NPD5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLCO1B3Q9NPD5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLCO1B3Q9NPD5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLCO1B3Q9NPD5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLCO1B3Q9NPD5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLCO1B3Q9NPD5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLCO1B3Q9NPD5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLCO1B3Q9NPD5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLCO1B3Q9NPD5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLCO1B3Q9NPD5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLCO1B3Q9NPD5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLCO1B3Q9NPD5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLCO1B3Q9NPD5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLCO1B3Q9NPD5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLCO1B3Q9NPD5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLCO1B3Q9NPD5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLCO1B3Q9NPD5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLCO1B3Q9NPD5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLCO1B3Q9NPD5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLCO1B3Q9NPD5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLCO1B3Q9NPD5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLCO1B3Q9NPD5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLCO1B3Q9NPD5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLCO1B3Q9NPD5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLCO1B3Q9NPD5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLCO1B3Q9NPD5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLCO1B3Q9NPD5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLCO1B3Q9NPD5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLCO1B3Q9NPD5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLCO1B3Q9NPD5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLCO1B3Q9NPD5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLCO1B3Q9NPD5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLCO1B3Q9NPD5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLCO1B3Q9NPD5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLCO1B3Q9NPD5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLCO1B3Q9NPD5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLCO1B3Q9NPD5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLCO1B3Q9NPD5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLCO1B3Q9NPD5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLCO1B3Q9NPD5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SLCO1B3Q9NPD5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLCO1B3Q9NPD5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLCO1B3Q9NPD5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLCO1B3Q9NPD5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLCO1B3Q9NPD5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLCO1B3Q9NPD5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLCO1B3Q9NPD5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLCO1B3Q9NPD5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLCO1B3Q9NPD5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLCO1B3Q9NPD5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLCO1B3Q9NPD5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLCO1B3Q9NPD5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLCO1B3Q9NPD5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLCO1B3Q9NPD5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLCO1B3Q9NPD5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLCO1B3Q9NPD5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLCO1B3Q9NPD5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLCO1B3Q9NPD5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLCO1B3Q9NPD5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLCO1B3Q9NPD5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLCO1B3Q9NPD5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLCO1B3Q9NPD5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLCO1B3Q9NPD5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLCO1B3Q9NPD5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLCO1B3Q9NPD5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLCO1B3Q9NPD5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLCO1B3Q9NPD5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLCO1B3Q9NPD5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLCO1B3Q9NPD5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLCO1B3Q9NPD5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLCO1B3Q9NPD5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLCO1B3Q9NPD5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLCO1B3Q9NPD5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLCO1B3Q9NPD5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLCO1B3Q9NPD5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLCO1B3Q9NPD5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLCO1B3Q9NPD5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLCO1B3Q9NPD5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLCO1B3Q9NPD5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLCO1B3Q9NPD5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLCO1B3Q9NPD5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLCO1B3Q9NPD5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms