Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCM1Q9NP62 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCM1Q9NP62 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCM1Q9NP62 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCM1Q9NP62 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCM1Q9NP62 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCM1Q9NP62 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCM1Q9NP62 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCM1Q9NP62 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GCM1Q9NP62 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCM1Q9NP62 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCM1Q9NP62 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCM1Q9NP62 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCM1Q9NP62 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCM1Q9NP62 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCM1Q9NP62 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCM1Q9NP62 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCM1Q9NP62 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCM1Q9NP62 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCM1Q9NP62 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCM1Q9NP62 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCM1Q9NP62 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCM1Q9NP62 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCM1Q9NP62 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCM1Q9NP62 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCM1Q9NP62 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCM1Q9NP62 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCM1Q9NP62 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCM1Q9NP62 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCM1Q9NP62 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCM1Q9NP62 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCM1Q9NP62 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCM1Q9NP62 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCM1Q9NP62 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCM1Q9NP62 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCM1Q9NP62 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCM1Q9NP62 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GCM1Q9NP62 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCM1Q9NP62 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCM1Q9NP62 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCM1Q9NP62 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCM1Q9NP62 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCM1Q9NP62 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCM1Q9NP62 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCM1Q9NP62 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCM1Q9NP62 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCM1Q9NP62 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCM1Q9NP62 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCM1Q9NP62 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCM1Q9NP62 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCM1Q9NP62 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCM1Q9NP62 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCM1Q9NP62 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCM1Q9NP62 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCM1Q9NP62 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCM1Q9NP62 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCM1Q9NP62 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GCM1Q9NP62 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCM1Q9NP62 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCM1Q9NP62 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCM1Q9NP62 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCM1Q9NP62 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GCM1Q9NP62 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCM1Q9NP62 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCM1Q9NP62 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCM1Q9NP62 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCM1Q9NP62 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCM1Q9NP62 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GCM1Q9NP62 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCM1Q9NP62 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCM1Q9NP62 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCM1Q9NP62 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCM1Q9NP62 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCM1Q9NP62 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCM1Q9NP62 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCM1Q9NP62 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCM1Q9NP62 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCM1Q9NP62 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCM1Q9NP62 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCM1Q9NP62 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCM1Q9NP62 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCM1Q9NP62 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCM1Q9NP62 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCM1Q9NP62 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCM1Q9NP62 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCM1Q9NP62 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCM1Q9NP62 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCM1Q9NP62 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCM1Q9NP62 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCM1Q9NP62 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCM1Q9NP62 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCM1Q9NP62 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCM1Q9NP62 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCM1Q9NP62 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCM1Q9NP62 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCM1Q9NP62 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCM1Q9NP62 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GCM1Q9NP62 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCM1Q9NP62 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCM1Q9NP62 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms