Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC07

TMEM165, Transmembrane protein 165, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM165Q9HC07 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM165Q9HC07 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM165Q9HC07 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM165Q9HC07 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM165Q9HC07 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM165Q9HC07 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM165Q9HC07 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM165Q9HC07 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM165Q9HC07 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM165Q9HC07 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM165Q9HC07 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM165Q9HC07 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM165Q9HC07 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM165Q9HC07 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM165Q9HC07 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM165Q9HC07 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM165Q9HC07 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM165Q9HC07 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM165Q9HC07 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM165Q9HC07 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM165Q9HC07 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM165Q9HC07 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM165Q9HC07 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM165Q9HC07 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM165Q9HC07 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM165Q9HC07 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM165Q9HC07 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM165Q9HC07 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM165Q9HC07 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM165Q9HC07 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM165Q9HC07 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM165Q9HC07 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM165Q9HC07 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM165Q9HC07 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM165Q9HC07 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM165Q9HC07 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM165Q9HC07 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM165Q9HC07 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM165Q9HC07 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM165Q9HC07 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM165Q9HC07 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM165Q9HC07 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM165Q9HC07 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM165Q9HC07 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM165Q9HC07 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM165Q9HC07 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM165Q9HC07 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM165Q9HC07 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM165Q9HC07 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM165Q9HC07 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM165Q9HC07 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM165Q9HC07 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM165Q9HC07 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM165Q9HC07 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM165Q9HC07 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM165Q9HC07 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM165Q9HC07 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM165Q9HC07 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM165Q9HC07 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM165Q9HC07 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM165Q9HC07 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM165Q9HC07 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM165Q9HC07 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM165Q9HC07 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM165Q9HC07 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM165Q9HC07 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM165Q9HC07 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM165Q9HC07 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM165Q9HC07 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM165Q9HC07 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM165Q9HC07 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM165Q9HC07 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM165Q9HC07 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM165Q9HC07 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM165Q9HC07 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM165Q9HC07 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM165Q9HC07 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM165Q9HC07 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM165Q9HC07 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM165Q9HC07 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM165Q9HC07 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM165Q9HC07 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM165Q9HC07 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM165Q9HC07 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM165Q9HC07 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM165Q9HC07 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM165Q9HC07 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM165Q9HC07 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM165Q9HC07 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM165Q9HC07 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM165Q9HC07 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM165Q9HC07 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM165Q9HC07 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM165Q9HC07 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM165Q9HC07 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM165Q9HC07 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM165Q9HC07 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM165Q9HC07 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM165Q9HC07 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM165Q9HC07 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms