Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB40

SCPEP1, Retinoid-inducible serine carboxypeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCPEP1Q9HB40 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCPEP1Q9HB40 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCPEP1Q9HB40 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCPEP1Q9HB40 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCPEP1Q9HB40 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCPEP1Q9HB40 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCPEP1Q9HB40 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCPEP1Q9HB40 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCPEP1Q9HB40 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCPEP1Q9HB40 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCPEP1Q9HB40 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCPEP1Q9HB40 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCPEP1Q9HB40 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCPEP1Q9HB40 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCPEP1Q9HB40 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCPEP1Q9HB40 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCPEP1Q9HB40 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCPEP1Q9HB40 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCPEP1Q9HB40 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCPEP1Q9HB40 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCPEP1Q9HB40 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCPEP1Q9HB40 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCPEP1Q9HB40 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCPEP1Q9HB40 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCPEP1Q9HB40 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCPEP1Q9HB40 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCPEP1Q9HB40 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCPEP1Q9HB40 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCPEP1Q9HB40 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCPEP1Q9HB40 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCPEP1Q9HB40 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCPEP1Q9HB40 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCPEP1Q9HB40 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCPEP1Q9HB40 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCPEP1Q9HB40 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCPEP1Q9HB40 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCPEP1Q9HB40 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCPEP1Q9HB40 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCPEP1Q9HB40 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCPEP1Q9HB40 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCPEP1Q9HB40 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCPEP1Q9HB40 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCPEP1Q9HB40 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCPEP1Q9HB40 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCPEP1Q9HB40 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCPEP1Q9HB40 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCPEP1Q9HB40 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCPEP1Q9HB40 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCPEP1Q9HB40 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCPEP1Q9HB40 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCPEP1Q9HB40 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCPEP1Q9HB40 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCPEP1Q9HB40 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCPEP1Q9HB40 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCPEP1Q9HB40 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCPEP1Q9HB40 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCPEP1Q9HB40 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCPEP1Q9HB40 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCPEP1Q9HB40 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCPEP1Q9HB40 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCPEP1Q9HB40 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCPEP1Q9HB40 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCPEP1Q9HB40 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCPEP1Q9HB40 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCPEP1Q9HB40 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCPEP1Q9HB40 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCPEP1Q9HB40 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCPEP1Q9HB40 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCPEP1Q9HB40 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCPEP1Q9HB40 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCPEP1Q9HB40 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCPEP1Q9HB40 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCPEP1Q9HB40 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCPEP1Q9HB40 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCPEP1Q9HB40 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCPEP1Q9HB40 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCPEP1Q9HB40 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCPEP1Q9HB40 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCPEP1Q9HB40 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCPEP1Q9HB40 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCPEP1Q9HB40 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCPEP1Q9HB40 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCPEP1Q9HB40 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCPEP1Q9HB40 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCPEP1Q9HB40 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCPEP1Q9HB40 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCPEP1Q9HB40 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCPEP1Q9HB40 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCPEP1Q9HB40 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCPEP1Q9HB40 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCPEP1Q9HB40 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCPEP1Q9HB40 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCPEP1Q9HB40 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCPEP1Q9HB40 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCPEP1Q9HB40 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCPEP1Q9HB40 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCPEP1Q9HB40 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCPEP1Q9HB40 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCPEP1Q9HB40 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCPEP1Q9HB40 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms