Protein–RNA interactions for Protein: Q9H841

NIPAL2, NIPA-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL2Q9H841 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIPAL2Q9H841 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIPAL2Q9H841 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIPAL2Q9H841 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NIPAL2Q9H841 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NIPAL2Q9H841 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPAL2Q9H841 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPAL2Q9H841 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPAL2Q9H841 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPAL2Q9H841 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIPAL2Q9H841 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPAL2Q9H841 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPAL2Q9H841 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPAL2Q9H841 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPAL2Q9H841 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPAL2Q9H841 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPAL2Q9H841 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPAL2Q9H841 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPAL2Q9H841 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPAL2Q9H841 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPAL2Q9H841 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPAL2Q9H841 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPAL2Q9H841 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPAL2Q9H841 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIPAL2Q9H841 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIPAL2Q9H841 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NIPAL2Q9H841 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPAL2Q9H841 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPAL2Q9H841 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPAL2Q9H841 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPAL2Q9H841 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPAL2Q9H841 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPAL2Q9H841 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPAL2Q9H841 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPAL2Q9H841 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPAL2Q9H841 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIPAL2Q9H841 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIPAL2Q9H841 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIPAL2Q9H841 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIPAL2Q9H841 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIPAL2Q9H841 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPAL2Q9H841 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPAL2Q9H841 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPAL2Q9H841 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIPAL2Q9H841 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIPAL2Q9H841 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NIPAL2Q9H841 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIPAL2Q9H841 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIPAL2Q9H841 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIPAL2Q9H841 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIPAL2Q9H841 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIPAL2Q9H841 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIPAL2Q9H841 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPAL2Q9H841 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPAL2Q9H841 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPAL2Q9H841 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPAL2Q9H841 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPAL2Q9H841 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPAL2Q9H841 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPAL2Q9H841 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPAL2Q9H841 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPAL2Q9H841 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPAL2Q9H841 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIPAL2Q9H841 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIPAL2Q9H841 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIPAL2Q9H841 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIPAL2Q9H841 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL2Q9H841 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL2Q9H841 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIPAL2Q9H841 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIPAL2Q9H841 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIPAL2Q9H841 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPAL2Q9H841 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIPAL2Q9H841 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIPAL2Q9H841 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIPAL2Q9H841 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPAL2Q9H841 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPAL2Q9H841 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPAL2Q9H841 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPAL2Q9H841 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPAL2Q9H841 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPAL2Q9H841 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPAL2Q9H841 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPAL2Q9H841 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPAL2Q9H841 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPAL2Q9H841 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPAL2Q9H841 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPAL2Q9H841 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPAL2Q9H841 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPAL2Q9H841 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPAL2Q9H841 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NIPAL2Q9H841 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPAL2Q9H841 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPAL2Q9H841 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPAL2Q9H841 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPAL2Q9H841 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPAL2Q9H841 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPAL2Q9H841 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPAL2Q9H841 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPAL2Q9H841 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms