Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5F2

C11orf1, UPF0686 protein C11orf1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf1Q9H5F2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C11orf1Q9H5F2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf1Q9H5F2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf1Q9H5F2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C11orf1Q9H5F2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf1Q9H5F2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf1Q9H5F2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C11orf1Q9H5F2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C11orf1Q9H5F2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf1Q9H5F2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf1Q9H5F2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf1Q9H5F2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf1Q9H5F2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf1Q9H5F2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf1Q9H5F2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf1Q9H5F2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf1Q9H5F2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf1Q9H5F2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf1Q9H5F2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf1Q9H5F2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf1Q9H5F2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf1Q9H5F2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf1Q9H5F2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf1Q9H5F2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf1Q9H5F2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf1Q9H5F2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf1Q9H5F2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf1Q9H5F2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C11orf1Q9H5F2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf1Q9H5F2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf1Q9H5F2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf1Q9H5F2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf1Q9H5F2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf1Q9H5F2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf1Q9H5F2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf1Q9H5F2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf1Q9H5F2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf1Q9H5F2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf1Q9H5F2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf1Q9H5F2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf1Q9H5F2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
C11orf1Q9H5F2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf1Q9H5F2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf1Q9H5F2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf1Q9H5F2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf1Q9H5F2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf1Q9H5F2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf1Q9H5F2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf1Q9H5F2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf1Q9H5F2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf1Q9H5F2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf1Q9H5F2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf1Q9H5F2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf1Q9H5F2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf1Q9H5F2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C11orf1Q9H5F2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf1Q9H5F2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf1Q9H5F2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf1Q9H5F2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf1Q9H5F2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf1Q9H5F2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf1Q9H5F2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf1Q9H5F2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf1Q9H5F2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf1Q9H5F2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf1Q9H5F2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf1Q9H5F2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf1Q9H5F2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf1Q9H5F2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf1Q9H5F2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf1Q9H5F2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf1Q9H5F2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf1Q9H5F2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf1Q9H5F2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf1Q9H5F2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf1Q9H5F2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf1Q9H5F2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf1Q9H5F2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf1Q9H5F2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf1Q9H5F2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf1Q9H5F2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf1Q9H5F2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf1Q9H5F2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf1Q9H5F2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf1Q9H5F2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf1Q9H5F2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf1Q9H5F2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf1Q9H5F2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf1Q9H5F2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf1Q9H5F2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf1Q9H5F2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf1Q9H5F2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf1Q9H5F2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf1Q9H5F2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf1Q9H5F2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf1Q9H5F2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf1Q9H5F2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf1Q9H5F2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf1Q9H5F2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf1Q9H5F2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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