Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC90BQ9GZT6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC90BQ9GZT6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC90BQ9GZT6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC90BQ9GZT6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC90BQ9GZT6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC90BQ9GZT6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC90BQ9GZT6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC90BQ9GZT6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC90BQ9GZT6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC90BQ9GZT6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC90BQ9GZT6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC90BQ9GZT6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC90BQ9GZT6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC90BQ9GZT6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC90BQ9GZT6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC90BQ9GZT6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC90BQ9GZT6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC90BQ9GZT6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC90BQ9GZT6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC90BQ9GZT6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC90BQ9GZT6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC90BQ9GZT6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC90BQ9GZT6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC90BQ9GZT6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC90BQ9GZT6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC90BQ9GZT6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC90BQ9GZT6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC90BQ9GZT6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC90BQ9GZT6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC90BQ9GZT6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC90BQ9GZT6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC90BQ9GZT6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC90BQ9GZT6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC90BQ9GZT6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC90BQ9GZT6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC90BQ9GZT6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC90BQ9GZT6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC90BQ9GZT6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC90BQ9GZT6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC90BQ9GZT6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC90BQ9GZT6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC90BQ9GZT6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC90BQ9GZT6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC90BQ9GZT6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC90BQ9GZT6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC90BQ9GZT6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC90BQ9GZT6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC90BQ9GZT6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC90BQ9GZT6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC90BQ9GZT6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC90BQ9GZT6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC90BQ9GZT6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC90BQ9GZT6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC90BQ9GZT6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC90BQ9GZT6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC90BQ9GZT6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC90BQ9GZT6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC90BQ9GZT6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC90BQ9GZT6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC90BQ9GZT6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC90BQ9GZT6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC90BQ9GZT6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC90BQ9GZT6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC90BQ9GZT6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC90BQ9GZT6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC90BQ9GZT6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC90BQ9GZT6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC90BQ9GZT6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC90BQ9GZT6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC90BQ9GZT6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC90BQ9GZT6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC90BQ9GZT6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC90BQ9GZT6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC90BQ9GZT6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC90BQ9GZT6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC90BQ9GZT6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC90BQ9GZT6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC90BQ9GZT6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC90BQ9GZT6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC90BQ9GZT6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC90BQ9GZT6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC90BQ9GZT6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC90BQ9GZT6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC90BQ9GZT6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC90BQ9GZT6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC90BQ9GZT6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC90BQ9GZT6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC90BQ9GZT6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC90BQ9GZT6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC90BQ9GZT6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC90BQ9GZT6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC90BQ9GZT6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC90BQ9GZT6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC90BQ9GZT6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC90BQ9GZT6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC90BQ9GZT6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms