Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NMES1Q9C002 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NMES1Q9C002 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NMES1Q9C002 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NMES1Q9C002 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NMES1Q9C002 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NMES1Q9C002 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NMES1Q9C002 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NMES1Q9C002 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NMES1Q9C002 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NMES1Q9C002 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NMES1Q9C002 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NMES1Q9C002 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NMES1Q9C002 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NMES1Q9C002 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NMES1Q9C002 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NMES1Q9C002 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NMES1Q9C002 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NMES1Q9C002 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NMES1Q9C002 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMES1Q9C002 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMES1Q9C002 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMES1Q9C002 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMES1Q9C002 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NMES1Q9C002 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NMES1Q9C002 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NMES1Q9C002 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NMES1Q9C002 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NMES1Q9C002 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NMES1Q9C002 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NMES1Q9C002 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NMES1Q9C002 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NMES1Q9C002 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NMES1Q9C002 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NMES1Q9C002 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NMES1Q9C002 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NMES1Q9C002 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NMES1Q9C002 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NMES1Q9C002 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NMES1Q9C002 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NMES1Q9C002 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NMES1Q9C002 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NMES1Q9C002 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NMES1Q9C002 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NMES1Q9C002 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NMES1Q9C002 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NMES1Q9C002 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NMES1Q9C002 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NMES1Q9C002 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NMES1Q9C002 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NMES1Q9C002 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NMES1Q9C002 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NMES1Q9C002 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMES1Q9C002 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMES1Q9C002 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMES1Q9C002 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMES1Q9C002 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMES1Q9C002 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMES1Q9C002 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMES1Q9C002 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMES1Q9C002 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMES1Q9C002 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMES1Q9C002 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMES1Q9C002 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMES1Q9C002 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NMES1Q9C002 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NMES1Q9C002 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NMES1Q9C002 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NMES1Q9C002 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NMES1Q9C002 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NMES1Q9C002 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMES1Q9C002 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMES1Q9C002 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMES1Q9C002 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NMES1Q9C002 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMES1Q9C002 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NMES1Q9C002 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NMES1Q9C002 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NMES1Q9C002 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NMES1Q9C002 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NMES1Q9C002 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NMES1Q9C002 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NMES1Q9C002 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMES1Q9C002 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMES1Q9C002 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMES1Q9C002 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMES1Q9C002 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMES1Q9C002 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMES1Q9C002 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMES1Q9C002 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMES1Q9C002 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMES1Q9C002 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NMES1Q9C002 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NMES1Q9C002 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NMES1Q9C002 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NMES1Q9C002 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMES1Q9C002 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMES1Q9C002 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMES1Q9C002 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMES1Q9C002 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms