Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC94Q9BW85 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC94Q9BW85 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC94Q9BW85 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC94Q9BW85 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC94Q9BW85 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC94Q9BW85 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC94Q9BW85 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC94Q9BW85 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC94Q9BW85 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC94Q9BW85 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC94Q9BW85 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC94Q9BW85 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC94Q9BW85 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC94Q9BW85 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC94Q9BW85 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC94Q9BW85 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC94Q9BW85 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC94Q9BW85 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC94Q9BW85 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC94Q9BW85 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC94Q9BW85 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC94Q9BW85 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC94Q9BW85 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC94Q9BW85 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC94Q9BW85 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC94Q9BW85 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC94Q9BW85 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC94Q9BW85 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC94Q9BW85 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC94Q9BW85 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC94Q9BW85 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC94Q9BW85 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC94Q9BW85 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC94Q9BW85 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC94Q9BW85 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC94Q9BW85 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC94Q9BW85 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC94Q9BW85 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC94Q9BW85 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC94Q9BW85 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC94Q9BW85 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC94Q9BW85 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC94Q9BW85 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC94Q9BW85 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC94Q9BW85 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC94Q9BW85 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC94Q9BW85 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC94Q9BW85 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC94Q9BW85 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC94Q9BW85 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC94Q9BW85 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CCDC94Q9BW85 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC94Q9BW85 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC94Q9BW85 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC94Q9BW85 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC94Q9BW85 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC94Q9BW85 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC94Q9BW85 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC94Q9BW85 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC94Q9BW85 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC94Q9BW85 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC94Q9BW85 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC94Q9BW85 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC94Q9BW85 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC94Q9BW85 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC94Q9BW85 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC94Q9BW85 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC94Q9BW85 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC94Q9BW85 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC94Q9BW85 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC94Q9BW85 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC94Q9BW85 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC94Q9BW85 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC94Q9BW85 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CCDC94Q9BW85 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC94Q9BW85 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC94Q9BW85 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC94Q9BW85 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC94Q9BW85 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC94Q9BW85 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC94Q9BW85 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC94Q9BW85 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC94Q9BW85 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC94Q9BW85 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC94Q9BW85 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC94Q9BW85 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC94Q9BW85 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC94Q9BW85 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC94Q9BW85 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC94Q9BW85 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC94Q9BW85 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CCDC94Q9BW85 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CCDC94Q9BW85 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC94Q9BW85 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC94Q9BW85 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC94Q9BW85 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC94Q9BW85 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC94Q9BW85 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC94Q9BW85 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms