Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PBDC1Q9BVG4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBDC1Q9BVG4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBDC1Q9BVG4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBDC1Q9BVG4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBDC1Q9BVG4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBDC1Q9BVG4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBDC1Q9BVG4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBDC1Q9BVG4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBDC1Q9BVG4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBDC1Q9BVG4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBDC1Q9BVG4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBDC1Q9BVG4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBDC1Q9BVG4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBDC1Q9BVG4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBDC1Q9BVG4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBDC1Q9BVG4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBDC1Q9BVG4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBDC1Q9BVG4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PBDC1Q9BVG4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBDC1Q9BVG4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBDC1Q9BVG4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBDC1Q9BVG4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBDC1Q9BVG4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBDC1Q9BVG4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBDC1Q9BVG4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PBDC1Q9BVG4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PBDC1Q9BVG4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PBDC1Q9BVG4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PBDC1Q9BVG4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBDC1Q9BVG4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBDC1Q9BVG4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PBDC1Q9BVG4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBDC1Q9BVG4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBDC1Q9BVG4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBDC1Q9BVG4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBDC1Q9BVG4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBDC1Q9BVG4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBDC1Q9BVG4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBDC1Q9BVG4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBDC1Q9BVG4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBDC1Q9BVG4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBDC1Q9BVG4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBDC1Q9BVG4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PBDC1Q9BVG4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBDC1Q9BVG4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBDC1Q9BVG4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBDC1Q9BVG4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBDC1Q9BVG4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBDC1Q9BVG4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBDC1Q9BVG4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBDC1Q9BVG4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBDC1Q9BVG4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PBDC1Q9BVG4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PBDC1Q9BVG4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBDC1Q9BVG4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBDC1Q9BVG4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBDC1Q9BVG4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBDC1Q9BVG4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBDC1Q9BVG4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBDC1Q9BVG4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBDC1Q9BVG4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBDC1Q9BVG4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBDC1Q9BVG4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBDC1Q9BVG4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBDC1Q9BVG4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBDC1Q9BVG4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBDC1Q9BVG4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBDC1Q9BVG4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBDC1Q9BVG4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBDC1Q9BVG4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBDC1Q9BVG4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBDC1Q9BVG4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBDC1Q9BVG4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBDC1Q9BVG4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBDC1Q9BVG4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBDC1Q9BVG4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBDC1Q9BVG4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBDC1Q9BVG4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBDC1Q9BVG4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBDC1Q9BVG4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBDC1Q9BVG4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBDC1Q9BVG4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBDC1Q9BVG4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBDC1Q9BVG4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBDC1Q9BVG4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PBDC1Q9BVG4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PBDC1Q9BVG4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PBDC1Q9BVG4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PBDC1Q9BVG4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PBDC1Q9BVG4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PBDC1Q9BVG4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PBDC1Q9BVG4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PBDC1Q9BVG4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PBDC1Q9BVG4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PBDC1Q9BVG4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PBDC1Q9BVG4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PBDC1Q9BVG4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PBDC1Q9BVG4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PBDC1Q9BVG4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms