Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV20

MRI1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRI1Q9BV20 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRI1Q9BV20 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MRI1Q9BV20 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRI1Q9BV20 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRI1Q9BV20 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRI1Q9BV20 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRI1Q9BV20 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRI1Q9BV20 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRI1Q9BV20 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRI1Q9BV20 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRI1Q9BV20 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRI1Q9BV20 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRI1Q9BV20 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRI1Q9BV20 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRI1Q9BV20 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRI1Q9BV20 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRI1Q9BV20 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRI1Q9BV20 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRI1Q9BV20 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRI1Q9BV20 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRI1Q9BV20 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRI1Q9BV20 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRI1Q9BV20 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRI1Q9BV20 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRI1Q9BV20 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRI1Q9BV20 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRI1Q9BV20 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRI1Q9BV20 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRI1Q9BV20 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRI1Q9BV20 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRI1Q9BV20 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRI1Q9BV20 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRI1Q9BV20 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRI1Q9BV20 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRI1Q9BV20 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRI1Q9BV20 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRI1Q9BV20 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRI1Q9BV20 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRI1Q9BV20 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRI1Q9BV20 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRI1Q9BV20 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRI1Q9BV20 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRI1Q9BV20 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRI1Q9BV20 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRI1Q9BV20 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRI1Q9BV20 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRI1Q9BV20 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRI1Q9BV20 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRI1Q9BV20 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRI1Q9BV20 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRI1Q9BV20 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRI1Q9BV20 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRI1Q9BV20 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRI1Q9BV20 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRI1Q9BV20 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRI1Q9BV20 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRI1Q9BV20 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRI1Q9BV20 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRI1Q9BV20 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRI1Q9BV20 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRI1Q9BV20 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRI1Q9BV20 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRI1Q9BV20 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRI1Q9BV20 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRI1Q9BV20 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRI1Q9BV20 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRI1Q9BV20 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRI1Q9BV20 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRI1Q9BV20 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRI1Q9BV20 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRI1Q9BV20 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MRI1Q9BV20 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRI1Q9BV20 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MRI1Q9BV20 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRI1Q9BV20 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRI1Q9BV20 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRI1Q9BV20 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRI1Q9BV20 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRI1Q9BV20 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MRI1Q9BV20 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRI1Q9BV20 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRI1Q9BV20 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRI1Q9BV20 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRI1Q9BV20 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRI1Q9BV20 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRI1Q9BV20 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRI1Q9BV20 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRI1Q9BV20 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MRI1Q9BV20 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRI1Q9BV20 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRI1Q9BV20 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRI1Q9BV20 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRI1Q9BV20 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRI1Q9BV20 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRI1Q9BV20 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRI1Q9BV20 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MRI1Q9BV20 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MRI1Q9BV20 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRI1Q9BV20 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRI1Q9BV20 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms