Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDUFAF3Q9BU61 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDUFAF3Q9BU61 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDUFAF3Q9BU61 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NDUFAF3Q9BU61 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDUFAF3Q9BU61 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDUFAF3Q9BU61 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDUFAF3Q9BU61 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDUFAF3Q9BU61 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDUFAF3Q9BU61 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDUFAF3Q9BU61 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFAF3Q9BU61 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFAF3Q9BU61 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFAF3Q9BU61 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NDUFAF3Q9BU61 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDUFAF3Q9BU61 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDUFAF3Q9BU61 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NDUFAF3Q9BU61 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NDUFAF3Q9BU61 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDUFAF3Q9BU61 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDUFAF3Q9BU61 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NDUFAF3Q9BU61 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDUFAF3Q9BU61 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDUFAF3Q9BU61 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NDUFAF3Q9BU61 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDUFAF3Q9BU61 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDUFAF3Q9BU61 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDUFAF3Q9BU61 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDUFAF3Q9BU61 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFAF3Q9BU61 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFAF3Q9BU61 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDUFAF3Q9BU61 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDUFAF3Q9BU61 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDUFAF3Q9BU61 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDUFAF3Q9BU61 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDUFAF3Q9BU61 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDUFAF3Q9BU61 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NDUFAF3Q9BU61 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDUFAF3Q9BU61 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDUFAF3Q9BU61 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDUFAF3Q9BU61 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDUFAF3Q9BU61 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDUFAF3Q9BU61 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDUFAF3Q9BU61 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFAF3Q9BU61 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFAF3Q9BU61 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDUFAF3Q9BU61 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NDUFAF3Q9BU61 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDUFAF3Q9BU61 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDUFAF3Q9BU61 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFAF3Q9BU61 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFAF3Q9BU61 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFAF3Q9BU61 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFAF3Q9BU61 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFAF3Q9BU61 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NDUFAF3Q9BU61 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDUFAF3Q9BU61 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDUFAF3Q9BU61 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDUFAF3Q9BU61 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDUFAF3Q9BU61 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDUFAF3Q9BU61 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NDUFAF3Q9BU61 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NDUFAF3Q9BU61 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDUFAF3Q9BU61 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDUFAF3Q9BU61 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NDUFAF3Q9BU61 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NDUFAF3Q9BU61 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDUFAF3Q9BU61 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDUFAF3Q9BU61 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFAF3Q9BU61 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NDUFAF3Q9BU61 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NDUFAF3Q9BU61 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NDUFAF3Q9BU61 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NDUFAF3Q9BU61 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NDUFAF3Q9BU61 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NDUFAF3Q9BU61 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFAF3Q9BU61 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFAF3Q9BU61 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFAF3Q9BU61 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFAF3Q9BU61 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFAF3Q9BU61 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NDUFAF3Q9BU61 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NDUFAF3Q9BU61 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NDUFAF3Q9BU61 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NDUFAF3Q9BU61 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NDUFAF3Q9BU61 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NDUFAF3Q9BU61 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NDUFAF3Q9BU61 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDUFAF3Q9BU61 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDUFAF3Q9BU61 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDUFAF3Q9BU61 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDUFAF3Q9BU61 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDUFAF3Q9BU61 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFAF3Q9BU61 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFAF3Q9BU61 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFAF3Q9BU61 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms