Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTKNQ9BST9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTKNQ9BST9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTKNQ9BST9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTKNQ9BST9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTKNQ9BST9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTKNQ9BST9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTKNQ9BST9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RTKNQ9BST9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTKNQ9BST9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTKNQ9BST9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTKNQ9BST9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTKNQ9BST9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTKNQ9BST9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTKNQ9BST9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTKNQ9BST9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTKNQ9BST9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTKNQ9BST9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTKNQ9BST9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTKNQ9BST9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTKNQ9BST9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTKNQ9BST9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RTKNQ9BST9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RTKNQ9BST9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTKNQ9BST9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTKNQ9BST9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTKNQ9BST9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTKNQ9BST9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTKNQ9BST9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTKNQ9BST9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTKNQ9BST9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTKNQ9BST9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTKNQ9BST9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTKNQ9BST9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTKNQ9BST9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTKNQ9BST9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTKNQ9BST9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTKNQ9BST9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTKNQ9BST9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTKNQ9BST9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTKNQ9BST9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTKNQ9BST9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTKNQ9BST9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTKNQ9BST9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTKNQ9BST9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTKNQ9BST9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTKNQ9BST9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RTKNQ9BST9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTKNQ9BST9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTKNQ9BST9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RTKNQ9BST9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTKNQ9BST9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTKNQ9BST9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTKNQ9BST9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RTKNQ9BST9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTKNQ9BST9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTKNQ9BST9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RTKNQ9BST9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTKNQ9BST9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTKNQ9BST9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTKNQ9BST9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTKNQ9BST9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTKNQ9BST9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTKNQ9BST9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTKNQ9BST9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTKNQ9BST9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTKNQ9BST9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTKNQ9BST9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTKNQ9BST9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTKNQ9BST9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTKNQ9BST9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTKNQ9BST9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTKNQ9BST9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTKNQ9BST9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTKNQ9BST9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTKNQ9BST9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTKNQ9BST9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTKNQ9BST9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RTKNQ9BST9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RTKNQ9BST9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTKNQ9BST9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTKNQ9BST9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RTKNQ9BST9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RTKNQ9BST9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTKNQ9BST9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTKNQ9BST9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTKNQ9BST9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTKNQ9BST9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTKNQ9BST9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTKNQ9BST9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTKNQ9BST9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTKNQ9BST9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTKNQ9BST9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTKNQ9BST9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTKNQ9BST9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTKNQ9BST9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTKNQ9BST9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTKNQ9BST9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTKNQ9BST9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTKNQ9BST9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms