Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC77Q9BR77 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC77Q9BR77 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC77Q9BR77 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC77Q9BR77 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC77Q9BR77 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC77Q9BR77 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC77Q9BR77 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC77Q9BR77 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC77Q9BR77 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC77Q9BR77 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC77Q9BR77 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC77Q9BR77 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC77Q9BR77 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC77Q9BR77 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC77Q9BR77 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC77Q9BR77 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC77Q9BR77 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC77Q9BR77 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC77Q9BR77 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC77Q9BR77 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC77Q9BR77 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC77Q9BR77 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC77Q9BR77 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC77Q9BR77 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC77Q9BR77 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC77Q9BR77 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC77Q9BR77 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC77Q9BR77 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC77Q9BR77 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC77Q9BR77 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC77Q9BR77 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC77Q9BR77 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC77Q9BR77 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC77Q9BR77 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC77Q9BR77 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC77Q9BR77 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC77Q9BR77 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC77Q9BR77 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC77Q9BR77 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC77Q9BR77 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC77Q9BR77 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC77Q9BR77 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC77Q9BR77 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC77Q9BR77 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC77Q9BR77 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC77Q9BR77 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC77Q9BR77 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC77Q9BR77 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC77Q9BR77 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC77Q9BR77 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC77Q9BR77 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC77Q9BR77 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC77Q9BR77 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC77Q9BR77 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC77Q9BR77 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC77Q9BR77 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC77Q9BR77 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC77Q9BR77 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC77Q9BR77 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC77Q9BR77 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC77Q9BR77 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC77Q9BR77 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC77Q9BR77 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC77Q9BR77 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC77Q9BR77 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC77Q9BR77 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC77Q9BR77 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC77Q9BR77 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC77Q9BR77 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC77Q9BR77 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC77Q9BR77 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC77Q9BR77 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC77Q9BR77 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC77Q9BR77 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC77Q9BR77 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC77Q9BR77 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC77Q9BR77 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC77Q9BR77 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC77Q9BR77 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC77Q9BR77 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC77Q9BR77 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC77Q9BR77 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC77Q9BR77 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC77Q9BR77 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC77Q9BR77 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC77Q9BR77 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC77Q9BR77 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC77Q9BR77 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC77Q9BR77 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC77Q9BR77 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC77Q9BR77 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC77Q9BR77 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC77Q9BR77 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC77Q9BR77 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC77Q9BR77 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC77Q9BR77 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC77Q9BR77 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC77Q9BR77 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC77Q9BR77 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms