Protein–RNA interactions for Protein: Q99969

RARRES2, Retinoic acid receptor responder protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES2Q99969 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RARRES2Q99969 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARRES2Q99969 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES2Q99969 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES2Q99969 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARRES2Q99969 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES2Q99969 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES2Q99969 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES2Q99969 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES2Q99969 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES2Q99969 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES2Q99969 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES2Q99969 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES2Q99969 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES2Q99969 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES2Q99969 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RARRES2Q99969 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES2Q99969 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES2Q99969 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES2Q99969 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES2Q99969 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES2Q99969 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES2Q99969 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES2Q99969 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES2Q99969 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES2Q99969 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES2Q99969 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES2Q99969 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES2Q99969 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES2Q99969 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES2Q99969 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES2Q99969 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES2Q99969 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES2Q99969 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES2Q99969 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES2Q99969 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARRES2Q99969 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES2Q99969 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARRES2Q99969 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES2Q99969 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES2Q99969 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARRES2Q99969 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARRES2Q99969 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES2Q99969 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARRES2Q99969 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARRES2Q99969 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RARRES2Q99969 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RARRES2Q99969 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RARRES2Q99969 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RARRES2Q99969 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RARRES2Q99969 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RARRES2Q99969 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RARRES2Q99969 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RARRES2Q99969 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RARRES2Q99969 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RARRES2Q99969 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RARRES2Q99969 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RARRES2Q99969 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RARRES2Q99969 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RARRES2Q99969 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RARRES2Q99969 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RARRES2Q99969 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RARRES2Q99969 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RARRES2Q99969 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RARRES2Q99969 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RARRES2Q99969 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RARRES2Q99969 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RARRES2Q99969 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RARRES2Q99969 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RARRES2Q99969 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RARRES2Q99969 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RARRES2Q99969 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RARRES2Q99969 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RARRES2Q99969 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RARRES2Q99969 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARRES2Q99969 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARRES2Q99969 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARRES2Q99969 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARRES2Q99969 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARRES2Q99969 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RARRES2Q99969 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RARRES2Q99969 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RARRES2Q99969 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RARRES2Q99969 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RARRES2Q99969 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RARRES2Q99969 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RARRES2Q99969 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RARRES2Q99969 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RARRES2Q99969 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RARRES2Q99969 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RARRES2Q99969 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RARRES2Q99969 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RARRES2Q99969 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RARRES2Q99969 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RARRES2Q99969 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RARRES2Q99969 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RARRES2Q99969 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RARRES2Q99969 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RARRES2Q99969 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RARRES2Q99969 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms