Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYCBPQ99417 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYCBPQ99417 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYCBPQ99417 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYCBPQ99417 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYCBPQ99417 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYCBPQ99417 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MYCBPQ99417 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYCBPQ99417 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYCBPQ99417 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYCBPQ99417 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYCBPQ99417 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYCBPQ99417 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYCBPQ99417 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MYCBPQ99417 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYCBPQ99417 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYCBPQ99417 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYCBPQ99417 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYCBPQ99417 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MYCBPQ99417 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYCBPQ99417 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYCBPQ99417 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYCBPQ99417 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYCBPQ99417 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYCBPQ99417 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYCBPQ99417 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYCBPQ99417 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYCBPQ99417 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYCBPQ99417 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYCBPQ99417 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYCBPQ99417 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYCBPQ99417 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYCBPQ99417 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYCBPQ99417 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYCBPQ99417 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYCBPQ99417 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MYCBPQ99417 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYCBPQ99417 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYCBPQ99417 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYCBPQ99417 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYCBPQ99417 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYCBPQ99417 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYCBPQ99417 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYCBPQ99417 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYCBPQ99417 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYCBPQ99417 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYCBPQ99417 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYCBPQ99417 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYCBPQ99417 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYCBPQ99417 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYCBPQ99417 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYCBPQ99417 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYCBPQ99417 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYCBPQ99417 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYCBPQ99417 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYCBPQ99417 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYCBPQ99417 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYCBPQ99417 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYCBPQ99417 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYCBPQ99417 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYCBPQ99417 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYCBPQ99417 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYCBPQ99417 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYCBPQ99417 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYCBPQ99417 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYCBPQ99417 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYCBPQ99417 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYCBPQ99417 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYCBPQ99417 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYCBPQ99417 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYCBPQ99417 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYCBPQ99417 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYCBPQ99417 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYCBPQ99417 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYCBPQ99417 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYCBPQ99417 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYCBPQ99417 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYCBPQ99417 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYCBPQ99417 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYCBPQ99417 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYCBPQ99417 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYCBPQ99417 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYCBPQ99417 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYCBPQ99417 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYCBPQ99417 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYCBPQ99417 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYCBPQ99417 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYCBPQ99417 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYCBPQ99417 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYCBPQ99417 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYCBPQ99417 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYCBPQ99417 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYCBPQ99417 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYCBPQ99417 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYCBPQ99417 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYCBPQ99417 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYCBPQ99417 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYCBPQ99417 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYCBPQ99417 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYCBPQ99417 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms