Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBL7Q96S82 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBL7Q96S82 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBL7Q96S82 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBL7Q96S82 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBL7Q96S82 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBL7Q96S82 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBL7Q96S82 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBL7Q96S82 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBL7Q96S82 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBL7Q96S82 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBL7Q96S82 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
UBL7Q96S82 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBL7Q96S82 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBL7Q96S82 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBL7Q96S82 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
UBL7Q96S82 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBL7Q96S82 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBL7Q96S82 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBL7Q96S82 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
UBL7Q96S82 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBL7Q96S82 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBL7Q96S82 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBL7Q96S82 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBL7Q96S82 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBL7Q96S82 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBL7Q96S82 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBL7Q96S82 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBL7Q96S82 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBL7Q96S82 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBL7Q96S82 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBL7Q96S82 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBL7Q96S82 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBL7Q96S82 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBL7Q96S82 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBL7Q96S82 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBL7Q96S82 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBL7Q96S82 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
UBL7Q96S82 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBL7Q96S82 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UBL7Q96S82 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBL7Q96S82 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBL7Q96S82 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBL7Q96S82 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBL7Q96S82 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBL7Q96S82 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBL7Q96S82 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBL7Q96S82 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBL7Q96S82 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBL7Q96S82 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBL7Q96S82 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBL7Q96S82 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBL7Q96S82 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBL7Q96S82 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBL7Q96S82 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBL7Q96S82 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
UBL7Q96S82 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBL7Q96S82 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
UBL7Q96S82 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBL7Q96S82 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBL7Q96S82 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBL7Q96S82 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBL7Q96S82 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
UBL7Q96S82 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBL7Q96S82 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBL7Q96S82 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBL7Q96S82 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBL7Q96S82 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBL7Q96S82 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBL7Q96S82 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBL7Q96S82 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBL7Q96S82 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBL7Q96S82 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
UBL7Q96S82 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBL7Q96S82 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBL7Q96S82 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBL7Q96S82 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBL7Q96S82 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBL7Q96S82 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBL7Q96S82 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBL7Q96S82 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBL7Q96S82 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBL7Q96S82 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBL7Q96S82 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBL7Q96S82 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBL7Q96S82 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UBL7Q96S82 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBL7Q96S82 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBL7Q96S82 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UBL7Q96S82 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBL7Q96S82 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBL7Q96S82 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBL7Q96S82 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBL7Q96S82 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
UBL7Q96S82 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBL7Q96S82 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBL7Q96S82 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBL7Q96S82 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBL7Q96S82 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBL7Q96S82 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms