Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A2Q96QD8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC38A2Q96QD8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC38A2Q96QD8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC38A2Q96QD8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC38A2Q96QD8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC38A2Q96QD8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC38A2Q96QD8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC38A2Q96QD8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC38A2Q96QD8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC38A2Q96QD8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC38A2Q96QD8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC38A2Q96QD8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC38A2Q96QD8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC38A2Q96QD8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC38A2Q96QD8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC38A2Q96QD8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC38A2Q96QD8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC38A2Q96QD8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC38A2Q96QD8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC38A2Q96QD8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC38A2Q96QD8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC38A2Q96QD8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC38A2Q96QD8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC38A2Q96QD8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC38A2Q96QD8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC38A2Q96QD8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC38A2Q96QD8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC38A2Q96QD8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC38A2Q96QD8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC38A2Q96QD8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC38A2Q96QD8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC38A2Q96QD8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC38A2Q96QD8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC38A2Q96QD8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC38A2Q96QD8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC38A2Q96QD8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC38A2Q96QD8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC38A2Q96QD8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC38A2Q96QD8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC38A2Q96QD8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC38A2Q96QD8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC38A2Q96QD8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC38A2Q96QD8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC38A2Q96QD8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC38A2Q96QD8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC38A2Q96QD8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC38A2Q96QD8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC38A2Q96QD8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC38A2Q96QD8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC38A2Q96QD8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC38A2Q96QD8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC38A2Q96QD8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC38A2Q96QD8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC38A2Q96QD8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC38A2Q96QD8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC38A2Q96QD8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC38A2Q96QD8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC38A2Q96QD8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC38A2Q96QD8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC38A2Q96QD8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC38A2Q96QD8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC38A2Q96QD8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC38A2Q96QD8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC38A2Q96QD8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC38A2Q96QD8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC38A2Q96QD8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC38A2Q96QD8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC38A2Q96QD8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC38A2Q96QD8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC38A2Q96QD8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC38A2Q96QD8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC38A2Q96QD8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC38A2Q96QD8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC38A2Q96QD8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC38A2Q96QD8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC38A2Q96QD8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC38A2Q96QD8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC38A2Q96QD8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC38A2Q96QD8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC38A2Q96QD8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC38A2Q96QD8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC38A2Q96QD8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC38A2Q96QD8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC38A2Q96QD8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC38A2Q96QD8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC38A2Q96QD8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC38A2Q96QD8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC38A2Q96QD8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC38A2Q96QD8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC38A2Q96QD8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC38A2Q96QD8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC38A2Q96QD8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC38A2Q96QD8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC38A2Q96QD8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC38A2Q96QD8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC38A2Q96QD8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC38A2Q96QD8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A2Q96QD8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A2Q96QD8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms