Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK15Q96Q40 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK15Q96Q40 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK15Q96Q40 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK15Q96Q40 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK15Q96Q40 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK15Q96Q40 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK15Q96Q40 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK15Q96Q40 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK15Q96Q40 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK15Q96Q40 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK15Q96Q40 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK15Q96Q40 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK15Q96Q40 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK15Q96Q40 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK15Q96Q40 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK15Q96Q40 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK15Q96Q40 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK15Q96Q40 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK15Q96Q40 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK15Q96Q40 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK15Q96Q40 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK15Q96Q40 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK15Q96Q40 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK15Q96Q40 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK15Q96Q40 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK15Q96Q40 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK15Q96Q40 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK15Q96Q40 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK15Q96Q40 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK15Q96Q40 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK15Q96Q40 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK15Q96Q40 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK15Q96Q40 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK15Q96Q40 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK15Q96Q40 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK15Q96Q40 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK15Q96Q40 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK15Q96Q40 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK15Q96Q40 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK15Q96Q40 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK15Q96Q40 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK15Q96Q40 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK15Q96Q40 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK15Q96Q40 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK15Q96Q40 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK15Q96Q40 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK15Q96Q40 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK15Q96Q40 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK15Q96Q40 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK15Q96Q40 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDK15Q96Q40 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK15Q96Q40 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK15Q96Q40 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK15Q96Q40 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK15Q96Q40 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK15Q96Q40 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK15Q96Q40 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK15Q96Q40 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK15Q96Q40 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK15Q96Q40 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK15Q96Q40 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK15Q96Q40 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK15Q96Q40 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK15Q96Q40 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK15Q96Q40 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK15Q96Q40 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK15Q96Q40 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK15Q96Q40 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK15Q96Q40 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK15Q96Q40 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK15Q96Q40 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK15Q96Q40 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK15Q96Q40 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK15Q96Q40 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK15Q96Q40 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK15Q96Q40 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK15Q96Q40 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK15Q96Q40 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK15Q96Q40 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK15Q96Q40 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK15Q96Q40 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK15Q96Q40 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK15Q96Q40 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK15Q96Q40 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK15Q96Q40 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK15Q96Q40 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK15Q96Q40 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK15Q96Q40 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK15Q96Q40 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK15Q96Q40 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK15Q96Q40 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK15Q96Q40 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK15Q96Q40 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK15Q96Q40 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK15Q96Q40 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK15Q96Q40 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK15Q96Q40 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK15Q96Q40 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK15Q96Q40 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms