Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RILPQ96NA2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RILPQ96NA2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RILPQ96NA2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RILPQ96NA2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RILPQ96NA2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RILPQ96NA2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RILPQ96NA2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RILPQ96NA2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RILPQ96NA2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RILPQ96NA2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RILPQ96NA2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RILPQ96NA2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RILPQ96NA2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RILPQ96NA2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RILPQ96NA2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RILPQ96NA2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RILPQ96NA2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RILPQ96NA2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RILPQ96NA2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RILPQ96NA2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RILPQ96NA2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RILPQ96NA2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RILPQ96NA2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RILPQ96NA2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RILPQ96NA2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RILPQ96NA2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RILPQ96NA2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RILPQ96NA2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RILPQ96NA2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RILPQ96NA2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RILPQ96NA2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RILPQ96NA2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RILPQ96NA2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RILPQ96NA2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RILPQ96NA2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RILPQ96NA2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RILPQ96NA2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RILPQ96NA2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RILPQ96NA2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RILPQ96NA2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RILPQ96NA2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RILPQ96NA2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RILPQ96NA2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RILPQ96NA2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RILPQ96NA2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RILPQ96NA2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RILPQ96NA2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RILPQ96NA2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RILPQ96NA2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RILPQ96NA2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RILPQ96NA2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RILPQ96NA2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RILPQ96NA2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RILPQ96NA2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RILPQ96NA2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RILPQ96NA2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RILPQ96NA2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RILPQ96NA2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RILPQ96NA2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RILPQ96NA2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RILPQ96NA2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RILPQ96NA2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RILPQ96NA2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RILPQ96NA2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RILPQ96NA2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RILPQ96NA2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RILPQ96NA2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RILPQ96NA2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RILPQ96NA2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RILPQ96NA2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RILPQ96NA2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
RILPQ96NA2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RILPQ96NA2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RILPQ96NA2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RILPQ96NA2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RILPQ96NA2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RILPQ96NA2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RILPQ96NA2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RILPQ96NA2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RILPQ96NA2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RILPQ96NA2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RILPQ96NA2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RILPQ96NA2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RILPQ96NA2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RILPQ96NA2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RILPQ96NA2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RILPQ96NA2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RILPQ96NA2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RILPQ96NA2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RILPQ96NA2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RILPQ96NA2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RILPQ96NA2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RILPQ96NA2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RILPQ96NA2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RILPQ96NA2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RILPQ96NA2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RILPQ96NA2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RILPQ96NA2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RILPQ96NA2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms