Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01600Q96MT4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01600Q96MT4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01600Q96MT4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01600Q96MT4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01600Q96MT4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01600Q96MT4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01600Q96MT4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01600Q96MT4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01600Q96MT4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01600Q96MT4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01600Q96MT4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01600Q96MT4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01600Q96MT4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01600Q96MT4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01600Q96MT4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01600Q96MT4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01600Q96MT4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01600Q96MT4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01600Q96MT4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01600Q96MT4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01600Q96MT4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01600Q96MT4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01600Q96MT4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC01600Q96MT4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC01600Q96MT4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC01600Q96MT4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC01600Q96MT4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC01600Q96MT4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01600Q96MT4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01600Q96MT4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01600Q96MT4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01600Q96MT4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01600Q96MT4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01600Q96MT4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01600Q96MT4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01600Q96MT4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01600Q96MT4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01600Q96MT4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01600Q96MT4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01600Q96MT4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01600Q96MT4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01600Q96MT4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01600Q96MT4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01600Q96MT4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01600Q96MT4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01600Q96MT4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01600Q96MT4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01600Q96MT4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01600Q96MT4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01600Q96MT4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01600Q96MT4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01600Q96MT4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01600Q96MT4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01600Q96MT4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01600Q96MT4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01600Q96MT4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01600Q96MT4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01600Q96MT4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01600Q96MT4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01600Q96MT4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01600Q96MT4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01600Q96MT4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01600Q96MT4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01600Q96MT4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01600Q96MT4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01600Q96MT4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01600Q96MT4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01600Q96MT4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01600Q96MT4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01600Q96MT4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01600Q96MT4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01600Q96MT4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01600Q96MT4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01600Q96MT4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01600Q96MT4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01600Q96MT4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01600Q96MT4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01600Q96MT4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01600Q96MT4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01600Q96MT4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01600Q96MT4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01600Q96MT4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01600Q96MT4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01600Q96MT4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01600Q96MT4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01600Q96MT4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01600Q96MT4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01600Q96MT4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01600Q96MT4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01600Q96MT4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01600Q96MT4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01600Q96MT4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms