Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKNOX2Q96KN3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKNOX2Q96KN3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKNOX2Q96KN3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PKNOX2Q96KN3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PKNOX2Q96KN3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKNOX2Q96KN3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKNOX2Q96KN3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PKNOX2Q96KN3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PKNOX2Q96KN3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKNOX2Q96KN3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKNOX2Q96KN3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PKNOX2Q96KN3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKNOX2Q96KN3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKNOX2Q96KN3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKNOX2Q96KN3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKNOX2Q96KN3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PKNOX2Q96KN3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PKNOX2Q96KN3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PKNOX2Q96KN3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PKNOX2Q96KN3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PKNOX2Q96KN3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PKNOX2Q96KN3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PKNOX2Q96KN3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKNOX2Q96KN3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PKNOX2Q96KN3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PKNOX2Q96KN3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PKNOX2Q96KN3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKNOX2Q96KN3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKNOX2Q96KN3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKNOX2Q96KN3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKNOX2Q96KN3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PKNOX2Q96KN3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKNOX2Q96KN3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKNOX2Q96KN3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PKNOX2Q96KN3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PKNOX2Q96KN3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PKNOX2Q96KN3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PKNOX2Q96KN3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PKNOX2Q96KN3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKNOX2Q96KN3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKNOX2Q96KN3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKNOX2Q96KN3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKNOX2Q96KN3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKNOX2Q96KN3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKNOX2Q96KN3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKNOX2Q96KN3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKNOX2Q96KN3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKNOX2Q96KN3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKNOX2Q96KN3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKNOX2Q96KN3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
PKNOX2Q96KN3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKNOX2Q96KN3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKNOX2Q96KN3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKNOX2Q96KN3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKNOX2Q96KN3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKNOX2Q96KN3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PKNOX2Q96KN3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PKNOX2Q96KN3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PKNOX2Q96KN3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PKNOX2Q96KN3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PKNOX2Q96KN3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PKNOX2Q96KN3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKNOX2Q96KN3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKNOX2Q96KN3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKNOX2Q96KN3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PKNOX2Q96KN3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PKNOX2Q96KN3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKNOX2Q96KN3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKNOX2Q96KN3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PKNOX2Q96KN3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PKNOX2Q96KN3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PKNOX2Q96KN3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKNOX2Q96KN3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKNOX2Q96KN3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKNOX2Q96KN3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PKNOX2Q96KN3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PKNOX2Q96KN3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PKNOX2Q96KN3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PKNOX2Q96KN3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PKNOX2Q96KN3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKNOX2Q96KN3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKNOX2Q96KN3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PKNOX2Q96KN3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PKNOX2Q96KN3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PKNOX2Q96KN3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PKNOX2Q96KN3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PKNOX2Q96KN3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PKNOX2Q96KN3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PKNOX2Q96KN3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PKNOX2Q96KN3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PKNOX2Q96KN3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PKNOX2Q96KN3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PKNOX2Q96KN3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PKNOX2Q96KN3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PKNOX2Q96KN3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PKNOX2Q96KN3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PKNOX2Q96KN3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PKNOX2Q96KN3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms