Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM8Q96KF7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM8Q96KF7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM8Q96KF7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM8Q96KF7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM8Q96KF7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM8Q96KF7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM8Q96KF7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM8Q96KF7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM8Q96KF7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM8Q96KF7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM8Q96KF7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM8Q96KF7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM8Q96KF7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM8Q96KF7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM8Q96KF7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM8Q96KF7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM8Q96KF7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM8Q96KF7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM8Q96KF7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM8Q96KF7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM8Q96KF7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM8Q96KF7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM8Q96KF7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM8Q96KF7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM8Q96KF7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM8Q96KF7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM8Q96KF7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM8Q96KF7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM8Q96KF7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM8Q96KF7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM8Q96KF7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM8Q96KF7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM8Q96KF7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM8Q96KF7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM8Q96KF7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM8Q96KF7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM8Q96KF7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM8Q96KF7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM8Q96KF7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM8Q96KF7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM8Q96KF7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM8Q96KF7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM8Q96KF7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM8Q96KF7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM8Q96KF7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM8Q96KF7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM8Q96KF7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM8Q96KF7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM8Q96KF7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM8Q96KF7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM8Q96KF7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM8Q96KF7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM8Q96KF7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM8Q96KF7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM8Q96KF7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM8Q96KF7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM8Q96KF7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM8Q96KF7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM8Q96KF7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM8Q96KF7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM8Q96KF7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM8Q96KF7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM8Q96KF7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM8Q96KF7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM8Q96KF7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM8Q96KF7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM8Q96KF7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM8Q96KF7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM8Q96KF7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM8Q96KF7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM8Q96KF7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM8Q96KF7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM8Q96KF7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM8Q96KF7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM8Q96KF7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM8Q96KF7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM8Q96KF7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM8Q96KF7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM8Q96KF7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM8Q96KF7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM8Q96KF7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM8Q96KF7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM8Q96KF7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM8Q96KF7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM8Q96KF7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM8Q96KF7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM8Q96KF7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM8Q96KF7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM8Q96KF7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMIM8Q96KF7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM8Q96KF7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM8Q96KF7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM8Q96KF7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM8Q96KF7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM8Q96KF7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM8Q96KF7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM8Q96KF7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM8Q96KF7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM8Q96KF7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms