Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHAMP1Q96JM3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHAMP1Q96JM3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHAMP1Q96JM3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHAMP1Q96JM3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHAMP1Q96JM3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHAMP1Q96JM3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHAMP1Q96JM3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHAMP1Q96JM3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHAMP1Q96JM3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHAMP1Q96JM3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHAMP1Q96JM3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHAMP1Q96JM3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHAMP1Q96JM3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHAMP1Q96JM3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHAMP1Q96JM3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHAMP1Q96JM3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CHAMP1Q96JM3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHAMP1Q96JM3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHAMP1Q96JM3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHAMP1Q96JM3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHAMP1Q96JM3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHAMP1Q96JM3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHAMP1Q96JM3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHAMP1Q96JM3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHAMP1Q96JM3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
CHAMP1Q96JM3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CHAMP1Q96JM3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CHAMP1Q96JM3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHAMP1Q96JM3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHAMP1Q96JM3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHAMP1Q96JM3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHAMP1Q96JM3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHAMP1Q96JM3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHAMP1Q96JM3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHAMP1Q96JM3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHAMP1Q96JM3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHAMP1Q96JM3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHAMP1Q96JM3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHAMP1Q96JM3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CHAMP1Q96JM3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHAMP1Q96JM3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHAMP1Q96JM3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHAMP1Q96JM3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHAMP1Q96JM3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHAMP1Q96JM3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHAMP1Q96JM3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHAMP1Q96JM3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHAMP1Q96JM3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHAMP1Q96JM3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHAMP1Q96JM3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CHAMP1Q96JM3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHAMP1Q96JM3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CHAMP1Q96JM3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CHAMP1Q96JM3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CHAMP1Q96JM3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CHAMP1Q96JM3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CHAMP1Q96JM3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CHAMP1Q96JM3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CHAMP1Q96JM3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CHAMP1Q96JM3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CHAMP1Q96JM3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CHAMP1Q96JM3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CHAMP1Q96JM3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CHAMP1Q96JM3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHAMP1Q96JM3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CHAMP1Q96JM3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
CHAMP1Q96JM3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CHAMP1Q96JM3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAMP1Q96JM3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHAMP1Q96JM3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHAMP1Q96JM3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHAMP1Q96JM3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHAMP1Q96JM3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
CHAMP1Q96JM3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHAMP1Q96JM3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHAMP1Q96JM3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHAMP1Q96JM3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CHAMP1Q96JM3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CHAMP1Q96JM3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHAMP1Q96JM3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHAMP1Q96JM3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHAMP1Q96JM3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHAMP1Q96JM3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CHAMP1Q96JM3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CHAMP1Q96JM3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHAMP1Q96JM3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CHAMP1Q96JM3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CHAMP1Q96JM3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CHAMP1Q96JM3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CHAMP1Q96JM3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CHAMP1Q96JM3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CHAMP1Q96JM3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHAMP1Q96JM3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHAMP1Q96JM3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHAMP1Q96JM3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
CHAMP1Q96JM3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHAMP1Q96JM3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHAMP1Q96JM3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHAMP1Q96JM3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms