Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF479Q96JC4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF479Q96JC4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF479Q96JC4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF479Q96JC4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF479Q96JC4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF479Q96JC4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF479Q96JC4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF479Q96JC4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF479Q96JC4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF479Q96JC4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF479Q96JC4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF479Q96JC4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF479Q96JC4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF479Q96JC4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF479Q96JC4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF479Q96JC4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF479Q96JC4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF479Q96JC4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF479Q96JC4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF479Q96JC4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF479Q96JC4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF479Q96JC4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF479Q96JC4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF479Q96JC4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF479Q96JC4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF479Q96JC4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF479Q96JC4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF479Q96JC4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF479Q96JC4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF479Q96JC4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF479Q96JC4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF479Q96JC4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF479Q96JC4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF479Q96JC4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF479Q96JC4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF479Q96JC4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF479Q96JC4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF479Q96JC4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF479Q96JC4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF479Q96JC4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF479Q96JC4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF479Q96JC4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF479Q96JC4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF479Q96JC4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF479Q96JC4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF479Q96JC4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF479Q96JC4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF479Q96JC4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF479Q96JC4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF479Q96JC4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF479Q96JC4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF479Q96JC4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF479Q96JC4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF479Q96JC4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF479Q96JC4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF479Q96JC4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF479Q96JC4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF479Q96JC4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF479Q96JC4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF479Q96JC4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF479Q96JC4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF479Q96JC4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF479Q96JC4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF479Q96JC4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF479Q96JC4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF479Q96JC4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF479Q96JC4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF479Q96JC4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF479Q96JC4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF479Q96JC4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF479Q96JC4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF479Q96JC4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF479Q96JC4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF479Q96JC4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF479Q96JC4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF479Q96JC4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF479Q96JC4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF479Q96JC4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF479Q96JC4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF479Q96JC4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF479Q96JC4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF479Q96JC4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF479Q96JC4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF479Q96JC4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF479Q96JC4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF479Q96JC4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF479Q96JC4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF479Q96JC4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF479Q96JC4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF479Q96JC4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF479Q96JC4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF479Q96JC4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF479Q96JC4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF479Q96JC4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF479Q96JC4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF479Q96JC4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF479Q96JC4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF479Q96JC4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF479Q96JC4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms