Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC34Q96HJ3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC34Q96HJ3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC34Q96HJ3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC34Q96HJ3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC34Q96HJ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC34Q96HJ3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC34Q96HJ3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC34Q96HJ3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC34Q96HJ3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC34Q96HJ3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC34Q96HJ3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC34Q96HJ3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CCDC34Q96HJ3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CCDC34Q96HJ3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC34Q96HJ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC34Q96HJ3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC34Q96HJ3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC34Q96HJ3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC34Q96HJ3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC34Q96HJ3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC34Q96HJ3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC34Q96HJ3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC34Q96HJ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC34Q96HJ3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC34Q96HJ3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC34Q96HJ3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC34Q96HJ3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC34Q96HJ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC34Q96HJ3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC34Q96HJ3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC34Q96HJ3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC34Q96HJ3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC34Q96HJ3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC34Q96HJ3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC34Q96HJ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC34Q96HJ3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC34Q96HJ3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC34Q96HJ3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC34Q96HJ3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC34Q96HJ3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC34Q96HJ3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC34Q96HJ3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC34Q96HJ3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC34Q96HJ3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC34Q96HJ3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC34Q96HJ3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC34Q96HJ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC34Q96HJ3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC34Q96HJ3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC34Q96HJ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC34Q96HJ3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC34Q96HJ3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC34Q96HJ3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC34Q96HJ3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC34Q96HJ3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC34Q96HJ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC34Q96HJ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC34Q96HJ3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC34Q96HJ3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC34Q96HJ3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC34Q96HJ3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC34Q96HJ3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC34Q96HJ3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC34Q96HJ3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC34Q96HJ3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC34Q96HJ3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC34Q96HJ3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC34Q96HJ3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC34Q96HJ3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
CCDC34Q96HJ3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC34Q96HJ3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC34Q96HJ3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC34Q96HJ3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC34Q96HJ3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC34Q96HJ3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC34Q96HJ3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC34Q96HJ3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC34Q96HJ3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC34Q96HJ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC34Q96HJ3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC34Q96HJ3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC34Q96HJ3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC34Q96HJ3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC34Q96HJ3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC34Q96HJ3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC34Q96HJ3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC34Q96HJ3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC34Q96HJ3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC34Q96HJ3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC34Q96HJ3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC34Q96HJ3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC34Q96HJ3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC34Q96HJ3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC34Q96HJ3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC34Q96HJ3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC34Q96HJ3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC34Q96HJ3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC34Q96HJ3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC34Q96HJ3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms