Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
BCANQ96GW7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
BCANQ96GW7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
BCANQ96GW7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
BCANQ96GW7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
BCANQ96GW7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
BCANQ96GW7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC40.69■■■■■ 4.1
BCANQ96GW7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
BCANQ96GW7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
BCANQ96GW7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
BCANQ96GW7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
BCANQ96GW7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
BCANQ96GW7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
BCANQ96GW7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
BCANQ96GW7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
BCANQ96GW7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
BCANQ96GW7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
BCANQ96GW7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
BCANQ96GW7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
BCANQ96GW7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
BCANQ96GW7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
BCANQ96GW7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
BCANQ96GW7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
BCANQ96GW7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
BCANQ96GW7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
BCANQ96GW7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
BCANQ96GW7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
BCANQ96GW7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
BCANQ96GW7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
BCANQ96GW7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
BCANQ96GW7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
BCANQ96GW7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
BCANQ96GW7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
BCANQ96GW7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
BCANQ96GW7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
BCANQ96GW7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
BCANQ96GW7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
BCANQ96GW7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
BCANQ96GW7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
BCANQ96GW7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
BCANQ96GW7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
BCANQ96GW7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
BCANQ96GW7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
BCANQ96GW7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
BCANQ96GW7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
BCANQ96GW7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
BCANQ96GW7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
BCANQ96GW7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
BCANQ96GW7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
BCANQ96GW7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
BCANQ96GW7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
BCANQ96GW7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
BCANQ96GW7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
BCANQ96GW7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
BCANQ96GW7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
BCANQ96GW7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
BCANQ96GW7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
BCANQ96GW7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
BCANQ96GW7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
BCANQ96GW7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
BCANQ96GW7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
BCANQ96GW7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
BCANQ96GW7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
BCANQ96GW7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
BCANQ96GW7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
BCANQ96GW7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
BCANQ96GW7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.04■■■■■ 4
BCANQ96GW7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
BCANQ96GW7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
BCANQ96GW7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
BCANQ96GW7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
BCANQ96GW7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
BCANQ96GW7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
BCANQ96GW7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
BCANQ96GW7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
BCANQ96GW7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
BCANQ96GW7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
BCANQ96GW7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
BCANQ96GW7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
BCANQ96GW7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
BCANQ96GW7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
BCANQ96GW7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
BCANQ96GW7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
BCANQ96GW7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
BCANQ96GW7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
BCANQ96GW7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
BCANQ96GW7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
BCANQ96GW7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
BCANQ96GW7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
BCANQ96GW7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
BCANQ96GW7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
BCANQ96GW7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
BCANQ96GW7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
BCANQ96GW7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
BCANQ96GW7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
BCANQ96GW7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
BCANQ96GW7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.95
BCANQ96GW7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
BCANQ96GW7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
BCANQ96GW7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms