Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ASIC4Q96FT7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ASIC4Q96FT7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ASIC4Q96FT7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ASIC4Q96FT7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ASIC4Q96FT7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ASIC4Q96FT7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ASIC4Q96FT7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ASIC4Q96FT7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ASIC4Q96FT7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ASIC4Q96FT7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ASIC4Q96FT7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ASIC4Q96FT7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ASIC4Q96FT7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ASIC4Q96FT7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ASIC4Q96FT7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ASIC4Q96FT7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ASIC4Q96FT7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ASIC4Q96FT7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ASIC4Q96FT7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ASIC4Q96FT7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ASIC4Q96FT7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ASIC4Q96FT7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ASIC4Q96FT7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ASIC4Q96FT7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ASIC4Q96FT7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ASIC4Q96FT7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ASIC4Q96FT7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ASIC4Q96FT7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ASIC4Q96FT7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ASIC4Q96FT7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ASIC4Q96FT7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ASIC4Q96FT7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ASIC4Q96FT7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ASIC4Q96FT7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ASIC4Q96FT7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ASIC4Q96FT7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ASIC4Q96FT7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ASIC4Q96FT7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ASIC4Q96FT7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ASIC4Q96FT7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ASIC4Q96FT7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ASIC4Q96FT7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ASIC4Q96FT7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ASIC4Q96FT7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ASIC4Q96FT7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ASIC4Q96FT7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ASIC4Q96FT7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ASIC4Q96FT7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ASIC4Q96FT7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ASIC4Q96FT7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ASIC4Q96FT7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ASIC4Q96FT7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ASIC4Q96FT7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ASIC4Q96FT7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ASIC4Q96FT7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ASIC4Q96FT7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ASIC4Q96FT7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ASIC4Q96FT7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ASIC4Q96FT7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ASIC4Q96FT7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ASIC4Q96FT7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ASIC4Q96FT7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ASIC4Q96FT7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ASIC4Q96FT7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ASIC4Q96FT7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ASIC4Q96FT7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ASIC4Q96FT7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ASIC4Q96FT7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ASIC4Q96FT7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ASIC4Q96FT7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ASIC4Q96FT7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ASIC4Q96FT7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ASIC4Q96FT7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ASIC4Q96FT7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ASIC4Q96FT7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ASIC4Q96FT7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ASIC4Q96FT7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ASIC4Q96FT7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ASIC4Q96FT7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ASIC4Q96FT7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ASIC4Q96FT7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ASIC4Q96FT7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ASIC4Q96FT7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ASIC4Q96FT7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ASIC4Q96FT7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ASIC4Q96FT7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ASIC4Q96FT7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ASIC4Q96FT7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ASIC4Q96FT7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ASIC4Q96FT7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ASIC4Q96FT7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ASIC4Q96FT7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ASIC4Q96FT7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ASIC4Q96FT7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ASIC4Q96FT7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ASIC4Q96FT7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ASIC4Q96FT7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ASIC4Q96FT7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ASIC4Q96FT7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms