Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3CQ96E17 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3CQ96E17 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3CQ96E17 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3CQ96E17 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3CQ96E17 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3CQ96E17 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3CQ96E17 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3CQ96E17 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3CQ96E17 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3CQ96E17 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3CQ96E17 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3CQ96E17 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3CQ96E17 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3CQ96E17 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3CQ96E17 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3CQ96E17 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3CQ96E17 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3CQ96E17 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3CQ96E17 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3CQ96E17 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3CQ96E17 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3CQ96E17 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3CQ96E17 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3CQ96E17 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3CQ96E17 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3CQ96E17 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3CQ96E17 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3CQ96E17 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3CQ96E17 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3CQ96E17 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3CQ96E17 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3CQ96E17 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3CQ96E17 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3CQ96E17 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3CQ96E17 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3CQ96E17 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3CQ96E17 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3CQ96E17 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3CQ96E17 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3CQ96E17 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3CQ96E17 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3CQ96E17 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3CQ96E17 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3CQ96E17 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3CQ96E17 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3CQ96E17 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3CQ96E17 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3CQ96E17 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3CQ96E17 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3CQ96E17 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3CQ96E17 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3CQ96E17 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3CQ96E17 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3CQ96E17 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3CQ96E17 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3CQ96E17 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3CQ96E17 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3CQ96E17 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB3CQ96E17 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3CQ96E17 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3CQ96E17 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3CQ96E17 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3CQ96E17 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3CQ96E17 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3CQ96E17 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3CQ96E17 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3CQ96E17 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3CQ96E17 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3CQ96E17 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3CQ96E17 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3CQ96E17 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3CQ96E17 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3CQ96E17 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3CQ96E17 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3CQ96E17 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3CQ96E17 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3CQ96E17 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3CQ96E17 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3CQ96E17 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3CQ96E17 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3CQ96E17 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3CQ96E17 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3CQ96E17 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3CQ96E17 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3CQ96E17 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3CQ96E17 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3CQ96E17 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3CQ96E17 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3CQ96E17 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3CQ96E17 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3CQ96E17 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3CQ96E17 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3CQ96E17 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3CQ96E17 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3CQ96E17 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB3CQ96E17 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3CQ96E17 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3CQ96E17 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3CQ96E17 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms