Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM63Q969Q1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM63Q969Q1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM63Q969Q1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM63Q969Q1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM63Q969Q1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM63Q969Q1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM63Q969Q1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM63Q969Q1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM63Q969Q1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM63Q969Q1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM63Q969Q1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM63Q969Q1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM63Q969Q1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM63Q969Q1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM63Q969Q1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM63Q969Q1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM63Q969Q1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM63Q969Q1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM63Q969Q1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM63Q969Q1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM63Q969Q1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM63Q969Q1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM63Q969Q1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM63Q969Q1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM63Q969Q1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM63Q969Q1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM63Q969Q1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM63Q969Q1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM63Q969Q1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM63Q969Q1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM63Q969Q1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM63Q969Q1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM63Q969Q1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM63Q969Q1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM63Q969Q1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM63Q969Q1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM63Q969Q1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM63Q969Q1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM63Q969Q1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM63Q969Q1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM63Q969Q1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM63Q969Q1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM63Q969Q1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM63Q969Q1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM63Q969Q1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM63Q969Q1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM63Q969Q1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM63Q969Q1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM63Q969Q1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM63Q969Q1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM63Q969Q1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM63Q969Q1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM63Q969Q1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM63Q969Q1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM63Q969Q1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM63Q969Q1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM63Q969Q1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM63Q969Q1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM63Q969Q1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM63Q969Q1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM63Q969Q1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM63Q969Q1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM63Q969Q1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM63Q969Q1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM63Q969Q1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM63Q969Q1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM63Q969Q1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM63Q969Q1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM63Q969Q1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM63Q969Q1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM63Q969Q1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM63Q969Q1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM63Q969Q1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM63Q969Q1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM63Q969Q1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM63Q969Q1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM63Q969Q1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM63Q969Q1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM63Q969Q1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM63Q969Q1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM63Q969Q1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM63Q969Q1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM63Q969Q1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM63Q969Q1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM63Q969Q1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM63Q969Q1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM63Q969Q1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM63Q969Q1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM63Q969Q1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM63Q969Q1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM63Q969Q1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM63Q969Q1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM63Q969Q1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM63Q969Q1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM63Q969Q1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM63Q969Q1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM63Q969Q1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM63Q969Q1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM63Q969Q1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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