Protein–RNA interactions for Protein: Q93062

RBPMS, RNA-binding protein with multiple splicing, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBPMSQ93062 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBPMSQ93062 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBPMSQ93062 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBPMSQ93062 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBPMSQ93062 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RBPMSQ93062 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBPMSQ93062 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBPMSQ93062 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBPMSQ93062 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBPMSQ93062 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBPMSQ93062 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBPMSQ93062 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBPMSQ93062 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBPMSQ93062 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBPMSQ93062 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBPMSQ93062 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBPMSQ93062 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBPMSQ93062 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBPMSQ93062 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBPMSQ93062 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBPMSQ93062 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBPMSQ93062 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBPMSQ93062 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBPMSQ93062 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RBPMSQ93062 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBPMSQ93062 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBPMSQ93062 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBPMSQ93062 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBPMSQ93062 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBPMSQ93062 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBPMSQ93062 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBPMSQ93062 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBPMSQ93062 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBPMSQ93062 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBPMSQ93062 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBPMSQ93062 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBPMSQ93062 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBPMSQ93062 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RBPMSQ93062 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBPMSQ93062 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBPMSQ93062 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBPMSQ93062 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBPMSQ93062 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBPMSQ93062 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBPMSQ93062 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBPMSQ93062 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBPMSQ93062 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBPMSQ93062 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBPMSQ93062 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBPMSQ93062 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBPMSQ93062 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBPMSQ93062 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBPMSQ93062 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBPMSQ93062 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBPMSQ93062 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RBPMSQ93062 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBPMSQ93062 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBPMSQ93062 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBPMSQ93062 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBPMSQ93062 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBPMSQ93062 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBPMSQ93062 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBPMSQ93062 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBPMSQ93062 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBPMSQ93062 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBPMSQ93062 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBPMSQ93062 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBPMSQ93062 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBPMSQ93062 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBPMSQ93062 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBPMSQ93062 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBPMSQ93062 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RBPMSQ93062 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBPMSQ93062 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBPMSQ93062 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBPMSQ93062 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBPMSQ93062 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBPMSQ93062 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBPMSQ93062 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBPMSQ93062 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBPMSQ93062 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBPMSQ93062 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBPMSQ93062 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBPMSQ93062 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBPMSQ93062 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBPMSQ93062 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBPMSQ93062 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBPMSQ93062 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBPMSQ93062 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBPMSQ93062 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBPMSQ93062 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBPMSQ93062 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBPMSQ93062 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBPMSQ93062 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBPMSQ93062 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBPMSQ93062 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBPMSQ93062 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBPMSQ93062 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBPMSQ93062 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBPMSQ93062 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms