Protein–RNA interactions for Protein: Q92930

RAB8B, Ras-related protein Rab-8B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8BQ92930 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB8BQ92930 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB8BQ92930 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB8BQ92930 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB8BQ92930 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB8BQ92930 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB8BQ92930 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB8BQ92930 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB8BQ92930 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB8BQ92930 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB8BQ92930 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB8BQ92930 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB8BQ92930 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB8BQ92930 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB8BQ92930 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB8BQ92930 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB8BQ92930 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB8BQ92930 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB8BQ92930 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB8BQ92930 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB8BQ92930 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB8BQ92930 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB8BQ92930 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB8BQ92930 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB8BQ92930 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB8BQ92930 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB8BQ92930 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB8BQ92930 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB8BQ92930 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB8BQ92930 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB8BQ92930 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB8BQ92930 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB8BQ92930 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB8BQ92930 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB8BQ92930 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB8BQ92930 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB8BQ92930 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB8BQ92930 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB8BQ92930 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB8BQ92930 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB8BQ92930 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB8BQ92930 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB8BQ92930 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB8BQ92930 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB8BQ92930 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB8BQ92930 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB8BQ92930 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB8BQ92930 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB8BQ92930 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB8BQ92930 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB8BQ92930 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB8BQ92930 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB8BQ92930 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB8BQ92930 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB8BQ92930 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB8BQ92930 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB8BQ92930 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB8BQ92930 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB8BQ92930 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB8BQ92930 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB8BQ92930 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB8BQ92930 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB8BQ92930 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB8BQ92930 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB8BQ92930 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB8BQ92930 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB8BQ92930 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB8BQ92930 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB8BQ92930 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB8BQ92930 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB8BQ92930 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB8BQ92930 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB8BQ92930 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB8BQ92930 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB8BQ92930 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB8BQ92930 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB8BQ92930 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB8BQ92930 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB8BQ92930 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB8BQ92930 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB8BQ92930 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB8BQ92930 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB8BQ92930 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB8BQ92930 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RAB8BQ92930 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB8BQ92930 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB8BQ92930 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB8BQ92930 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB8BQ92930 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB8BQ92930 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB8BQ92930 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB8BQ92930 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB8BQ92930 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB8BQ92930 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB8BQ92930 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB8BQ92930 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB8BQ92930 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB8BQ92930 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB8BQ92930 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB8BQ92930 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms