Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RORBQ92753 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RORBQ92753 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RORBQ92753 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RORBQ92753 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RORBQ92753 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RORBQ92753 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RORBQ92753 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RORBQ92753 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RORBQ92753 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RORBQ92753 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RORBQ92753 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RORBQ92753 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RORBQ92753 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RORBQ92753 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RORBQ92753 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RORBQ92753 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RORBQ92753 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RORBQ92753 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RORBQ92753 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RORBQ92753 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RORBQ92753 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RORBQ92753 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RORBQ92753 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RORBQ92753 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RORBQ92753 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RORBQ92753 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RORBQ92753 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RORBQ92753 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RORBQ92753 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RORBQ92753 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RORBQ92753 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RORBQ92753 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RORBQ92753 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RORBQ92753 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RORBQ92753 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RORBQ92753 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RORBQ92753 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RORBQ92753 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RORBQ92753 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RORBQ92753 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RORBQ92753 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RORBQ92753 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RORBQ92753 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RORBQ92753 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RORBQ92753 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RORBQ92753 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RORBQ92753 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RORBQ92753 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RORBQ92753 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RORBQ92753 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RORBQ92753 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RORBQ92753 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RORBQ92753 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RORBQ92753 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RORBQ92753 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RORBQ92753 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RORBQ92753 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RORBQ92753 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RORBQ92753 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RORBQ92753 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RORBQ92753 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RORBQ92753 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RORBQ92753 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RORBQ92753 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RORBQ92753 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RORBQ92753 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RORBQ92753 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RORBQ92753 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RORBQ92753 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RORBQ92753 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RORBQ92753 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RORBQ92753 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RORBQ92753 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RORBQ92753 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RORBQ92753 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RORBQ92753 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RORBQ92753 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RORBQ92753 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RORBQ92753 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RORBQ92753 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RORBQ92753 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RORBQ92753 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RORBQ92753 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RORBQ92753 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RORBQ92753 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RORBQ92753 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RORBQ92753 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RORBQ92753 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RORBQ92753 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RORBQ92753 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RORBQ92753 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RORBQ92753 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RORBQ92753 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RORBQ92753 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RORBQ92753 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RORBQ92753 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RORBQ92753 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RORBQ92753 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RORBQ92753 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms