Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ04

LRTOMT, Transmembrane O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTOMTQ8WZ04 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRTOMTQ8WZ04 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRTOMTQ8WZ04 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRTOMTQ8WZ04 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRTOMTQ8WZ04 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRTOMTQ8WZ04 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRTOMTQ8WZ04 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRTOMTQ8WZ04 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRTOMTQ8WZ04 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRTOMTQ8WZ04 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRTOMTQ8WZ04 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRTOMTQ8WZ04 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRTOMTQ8WZ04 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRTOMTQ8WZ04 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRTOMTQ8WZ04 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LRTOMTQ8WZ04 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRTOMTQ8WZ04 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRTOMTQ8WZ04 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRTOMTQ8WZ04 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRTOMTQ8WZ04 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRTOMTQ8WZ04 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRTOMTQ8WZ04 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRTOMTQ8WZ04 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRTOMTQ8WZ04 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRTOMTQ8WZ04 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRTOMTQ8WZ04 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRTOMTQ8WZ04 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRTOMTQ8WZ04 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRTOMTQ8WZ04 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRTOMTQ8WZ04 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRTOMTQ8WZ04 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRTOMTQ8WZ04 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRTOMTQ8WZ04 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRTOMTQ8WZ04 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRTOMTQ8WZ04 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRTOMTQ8WZ04 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRTOMTQ8WZ04 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRTOMTQ8WZ04 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRTOMTQ8WZ04 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRTOMTQ8WZ04 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRTOMTQ8WZ04 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRTOMTQ8WZ04 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRTOMTQ8WZ04 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRTOMTQ8WZ04 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRTOMTQ8WZ04 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRTOMTQ8WZ04 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRTOMTQ8WZ04 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRTOMTQ8WZ04 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRTOMTQ8WZ04 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRTOMTQ8WZ04 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRTOMTQ8WZ04 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRTOMTQ8WZ04 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRTOMTQ8WZ04 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRTOMTQ8WZ04 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRTOMTQ8WZ04 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRTOMTQ8WZ04 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRTOMTQ8WZ04 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRTOMTQ8WZ04 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRTOMTQ8WZ04 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRTOMTQ8WZ04 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRTOMTQ8WZ04 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRTOMTQ8WZ04 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRTOMTQ8WZ04 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRTOMTQ8WZ04 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRTOMTQ8WZ04 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRTOMTQ8WZ04 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRTOMTQ8WZ04 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRTOMTQ8WZ04 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRTOMTQ8WZ04 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRTOMTQ8WZ04 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRTOMTQ8WZ04 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LRTOMTQ8WZ04 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRTOMTQ8WZ04 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRTOMTQ8WZ04 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRTOMTQ8WZ04 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRTOMTQ8WZ04 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRTOMTQ8WZ04 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRTOMTQ8WZ04 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRTOMTQ8WZ04 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRTOMTQ8WZ04 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRTOMTQ8WZ04 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRTOMTQ8WZ04 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRTOMTQ8WZ04 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRTOMTQ8WZ04 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRTOMTQ8WZ04 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRTOMTQ8WZ04 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRTOMTQ8WZ04 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRTOMTQ8WZ04 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRTOMTQ8WZ04 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRTOMTQ8WZ04 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRTOMTQ8WZ04 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRTOMTQ8WZ04 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRTOMTQ8WZ04 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRTOMTQ8WZ04 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRTOMTQ8WZ04 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRTOMTQ8WZ04 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRTOMTQ8WZ04 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRTOMTQ8WZ04 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRTOMTQ8WZ04 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRTOMTQ8WZ04 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms