Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWV3

RTN4IP1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4IP1Q8WWV3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4IP1Q8WWV3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4IP1Q8WWV3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RTN4IP1Q8WWV3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4IP1Q8WWV3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4IP1Q8WWV3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4IP1Q8WWV3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4IP1Q8WWV3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN4IP1Q8WWV3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN4IP1Q8WWV3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTN4IP1Q8WWV3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTN4IP1Q8WWV3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTN4IP1Q8WWV3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN4IP1Q8WWV3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN4IP1Q8WWV3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN4IP1Q8WWV3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN4IP1Q8WWV3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN4IP1Q8WWV3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4IP1Q8WWV3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4IP1Q8WWV3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4IP1Q8WWV3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4IP1Q8WWV3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4IP1Q8WWV3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4IP1Q8WWV3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4IP1Q8WWV3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4IP1Q8WWV3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN4IP1Q8WWV3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4IP1Q8WWV3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4IP1Q8WWV3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4IP1Q8WWV3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4IP1Q8WWV3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4IP1Q8WWV3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4IP1Q8WWV3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4IP1Q8WWV3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4IP1Q8WWV3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4IP1Q8WWV3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4IP1Q8WWV3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4IP1Q8WWV3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4IP1Q8WWV3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4IP1Q8WWV3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4IP1Q8WWV3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4IP1Q8WWV3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4IP1Q8WWV3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4IP1Q8WWV3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN4IP1Q8WWV3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN4IP1Q8WWV3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4IP1Q8WWV3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4IP1Q8WWV3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4IP1Q8WWV3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4IP1Q8WWV3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4IP1Q8WWV3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4IP1Q8WWV3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4IP1Q8WWV3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4IP1Q8WWV3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4IP1Q8WWV3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4IP1Q8WWV3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RTN4IP1Q8WWV3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4IP1Q8WWV3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4IP1Q8WWV3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4IP1Q8WWV3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4IP1Q8WWV3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4IP1Q8WWV3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4IP1Q8WWV3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4IP1Q8WWV3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4IP1Q8WWV3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN4IP1Q8WWV3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN4IP1Q8WWV3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4IP1Q8WWV3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4IP1Q8WWV3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4IP1Q8WWV3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4IP1Q8WWV3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4IP1Q8WWV3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN4IP1Q8WWV3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN4IP1Q8WWV3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTN4IP1Q8WWV3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4IP1Q8WWV3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4IP1Q8WWV3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4IP1Q8WWV3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4IP1Q8WWV3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4IP1Q8WWV3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4IP1Q8WWV3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4IP1Q8WWV3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4IP1Q8WWV3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4IP1Q8WWV3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4IP1Q8WWV3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4IP1Q8WWV3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4IP1Q8WWV3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4IP1Q8WWV3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4IP1Q8WWV3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4IP1Q8WWV3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4IP1Q8WWV3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4IP1Q8WWV3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4IP1Q8WWV3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4IP1Q8WWV3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4IP1Q8WWV3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4IP1Q8WWV3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN4IP1Q8WWV3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4IP1Q8WWV3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4IP1Q8WWV3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4IP1Q8WWV3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms