Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWH5

TRUB1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB1Q8WWH5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRUB1Q8WWH5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRUB1Q8WWH5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRUB1Q8WWH5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRUB1Q8WWH5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRUB1Q8WWH5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRUB1Q8WWH5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRUB1Q8WWH5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRUB1Q8WWH5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRUB1Q8WWH5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRUB1Q8WWH5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRUB1Q8WWH5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRUB1Q8WWH5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRUB1Q8WWH5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRUB1Q8WWH5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRUB1Q8WWH5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRUB1Q8WWH5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRUB1Q8WWH5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRUB1Q8WWH5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRUB1Q8WWH5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRUB1Q8WWH5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRUB1Q8WWH5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRUB1Q8WWH5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRUB1Q8WWH5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRUB1Q8WWH5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRUB1Q8WWH5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRUB1Q8WWH5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRUB1Q8WWH5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRUB1Q8WWH5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRUB1Q8WWH5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRUB1Q8WWH5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRUB1Q8WWH5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRUB1Q8WWH5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRUB1Q8WWH5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRUB1Q8WWH5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRUB1Q8WWH5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRUB1Q8WWH5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRUB1Q8WWH5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRUB1Q8WWH5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRUB1Q8WWH5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRUB1Q8WWH5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRUB1Q8WWH5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRUB1Q8WWH5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRUB1Q8WWH5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRUB1Q8WWH5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRUB1Q8WWH5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRUB1Q8WWH5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRUB1Q8WWH5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRUB1Q8WWH5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRUB1Q8WWH5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRUB1Q8WWH5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRUB1Q8WWH5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRUB1Q8WWH5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRUB1Q8WWH5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRUB1Q8WWH5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRUB1Q8WWH5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRUB1Q8WWH5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRUB1Q8WWH5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRUB1Q8WWH5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRUB1Q8WWH5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRUB1Q8WWH5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRUB1Q8WWH5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRUB1Q8WWH5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRUB1Q8WWH5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRUB1Q8WWH5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRUB1Q8WWH5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRUB1Q8WWH5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRUB1Q8WWH5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRUB1Q8WWH5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRUB1Q8WWH5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRUB1Q8WWH5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRUB1Q8WWH5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRUB1Q8WWH5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRUB1Q8WWH5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRUB1Q8WWH5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRUB1Q8WWH5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRUB1Q8WWH5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRUB1Q8WWH5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRUB1Q8WWH5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRUB1Q8WWH5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TRUB1Q8WWH5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRUB1Q8WWH5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRUB1Q8WWH5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRUB1Q8WWH5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRUB1Q8WWH5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRUB1Q8WWH5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRUB1Q8WWH5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRUB1Q8WWH5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRUB1Q8WWH5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRUB1Q8WWH5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRUB1Q8WWH5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRUB1Q8WWH5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRUB1Q8WWH5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRUB1Q8WWH5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRUB1Q8WWH5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRUB1Q8WWH5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRUB1Q8WWH5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRUB1Q8WWH5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRUB1Q8WWH5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRUB1Q8WWH5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms