Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVI7

PPP1R1C, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1C, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1CQ8WVI7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1CQ8WVI7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R1CQ8WVI7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R1CQ8WVI7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R1CQ8WVI7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R1CQ8WVI7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R1CQ8WVI7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R1CQ8WVI7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R1CQ8WVI7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R1CQ8WVI7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R1CQ8WVI7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R1CQ8WVI7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R1CQ8WVI7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R1CQ8WVI7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R1CQ8WVI7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R1CQ8WVI7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R1CQ8WVI7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1R1CQ8WVI7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1R1CQ8WVI7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP1R1CQ8WVI7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP1R1CQ8WVI7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1R1CQ8WVI7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1R1CQ8WVI7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1R1CQ8WVI7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R1CQ8WVI7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R1CQ8WVI7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R1CQ8WVI7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R1CQ8WVI7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R1CQ8WVI7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R1CQ8WVI7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R1CQ8WVI7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R1CQ8WVI7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R1CQ8WVI7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R1CQ8WVI7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R1CQ8WVI7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R1CQ8WVI7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R1CQ8WVI7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R1CQ8WVI7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R1CQ8WVI7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R1CQ8WVI7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R1CQ8WVI7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R1CQ8WVI7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R1CQ8WVI7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R1CQ8WVI7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R1CQ8WVI7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP1R1CQ8WVI7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R1CQ8WVI7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R1CQ8WVI7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R1CQ8WVI7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R1CQ8WVI7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R1CQ8WVI7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R1CQ8WVI7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R1CQ8WVI7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R1CQ8WVI7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R1CQ8WVI7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R1CQ8WVI7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R1CQ8WVI7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R1CQ8WVI7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R1CQ8WVI7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R1CQ8WVI7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R1CQ8WVI7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R1CQ8WVI7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R1CQ8WVI7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R1CQ8WVI7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R1CQ8WVI7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R1CQ8WVI7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R1CQ8WVI7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R1CQ8WVI7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R1CQ8WVI7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R1CQ8WVI7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R1CQ8WVI7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R1CQ8WVI7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R1CQ8WVI7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R1CQ8WVI7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R1CQ8WVI7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R1CQ8WVI7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R1CQ8WVI7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R1CQ8WVI7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R1CQ8WVI7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R1CQ8WVI7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPP1R1CQ8WVI7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R1CQ8WVI7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R1CQ8WVI7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R1CQ8WVI7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R1CQ8WVI7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R1CQ8WVI7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R1CQ8WVI7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1CQ8WVI7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1CQ8WVI7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1CQ8WVI7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1CQ8WVI7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1CQ8WVI7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1CQ8WVI7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R1CQ8WVI7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R1CQ8WVI7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R1CQ8WVI7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R1CQ8WVI7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R1CQ8WVI7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R1CQ8WVI7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R1CQ8WVI7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms