Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFT2D1Q8WV19 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFT2D1Q8WV19 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFT2D1Q8WV19 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFT2D1Q8WV19 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFT2D1Q8WV19 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFT2D1Q8WV19 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFT2D1Q8WV19 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFT2D1Q8WV19 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFT2D1Q8WV19 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFT2D1Q8WV19 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFT2D1Q8WV19 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFT2D1Q8WV19 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFT2D1Q8WV19 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFT2D1Q8WV19 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFT2D1Q8WV19 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFT2D1Q8WV19 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFT2D1Q8WV19 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFT2D1Q8WV19 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFT2D1Q8WV19 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D1Q8WV19 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D1Q8WV19 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFT2D1Q8WV19 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFT2D1Q8WV19 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFT2D1Q8WV19 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFT2D1Q8WV19 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFT2D1Q8WV19 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFT2D1Q8WV19 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFT2D1Q8WV19 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFT2D1Q8WV19 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFT2D1Q8WV19 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SFT2D1Q8WV19 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFT2D1Q8WV19 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFT2D1Q8WV19 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFT2D1Q8WV19 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D1Q8WV19 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D1Q8WV19 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D1Q8WV19 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SFT2D1Q8WV19 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFT2D1Q8WV19 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFT2D1Q8WV19 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFT2D1Q8WV19 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFT2D1Q8WV19 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFT2D1Q8WV19 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFT2D1Q8WV19 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SFT2D1Q8WV19 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFT2D1Q8WV19 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFT2D1Q8WV19 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFT2D1Q8WV19 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFT2D1Q8WV19 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFT2D1Q8WV19 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFT2D1Q8WV19 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFT2D1Q8WV19 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFT2D1Q8WV19 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFT2D1Q8WV19 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFT2D1Q8WV19 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFT2D1Q8WV19 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D1Q8WV19 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D1Q8WV19 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFT2D1Q8WV19 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFT2D1Q8WV19 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFT2D1Q8WV19 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFT2D1Q8WV19 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFT2D1Q8WV19 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFT2D1Q8WV19 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFT2D1Q8WV19 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFT2D1Q8WV19 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFT2D1Q8WV19 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFT2D1Q8WV19 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFT2D1Q8WV19 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFT2D1Q8WV19 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFT2D1Q8WV19 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFT2D1Q8WV19 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFT2D1Q8WV19 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SFT2D1Q8WV19 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFT2D1Q8WV19 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFT2D1Q8WV19 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFT2D1Q8WV19 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFT2D1Q8WV19 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D1Q8WV19 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFT2D1Q8WV19 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFT2D1Q8WV19 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFT2D1Q8WV19 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFT2D1Q8WV19 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFT2D1Q8WV19 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D1Q8WV19 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D1Q8WV19 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFT2D1Q8WV19 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D1Q8WV19 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D1Q8WV19 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D1Q8WV19 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFT2D1Q8WV19 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFT2D1Q8WV19 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFT2D1Q8WV19 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFT2D1Q8WV19 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFT2D1Q8WV19 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFT2D1Q8WV19 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFT2D1Q8WV19 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFT2D1Q8WV19 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFT2D1Q8WV19 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms