Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBM7

TMEM254, Transmembrane protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM254Q8TBM7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM254Q8TBM7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM254Q8TBM7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM254Q8TBM7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM254Q8TBM7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM254Q8TBM7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM254Q8TBM7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM254Q8TBM7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM254Q8TBM7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM254Q8TBM7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM254Q8TBM7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM254Q8TBM7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM254Q8TBM7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM254Q8TBM7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM254Q8TBM7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM254Q8TBM7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM254Q8TBM7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM254Q8TBM7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM254Q8TBM7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM254Q8TBM7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM254Q8TBM7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM254Q8TBM7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM254Q8TBM7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM254Q8TBM7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM254Q8TBM7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM254Q8TBM7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM254Q8TBM7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM254Q8TBM7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM254Q8TBM7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM254Q8TBM7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM254Q8TBM7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM254Q8TBM7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM254Q8TBM7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM254Q8TBM7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM254Q8TBM7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM254Q8TBM7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM254Q8TBM7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM254Q8TBM7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM254Q8TBM7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM254Q8TBM7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM254Q8TBM7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM254Q8TBM7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM254Q8TBM7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM254Q8TBM7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM254Q8TBM7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM254Q8TBM7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM254Q8TBM7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM254Q8TBM7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM254Q8TBM7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM254Q8TBM7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM254Q8TBM7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM254Q8TBM7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM254Q8TBM7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM254Q8TBM7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM254Q8TBM7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM254Q8TBM7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM254Q8TBM7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM254Q8TBM7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM254Q8TBM7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM254Q8TBM7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM254Q8TBM7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM254Q8TBM7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM254Q8TBM7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM254Q8TBM7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM254Q8TBM7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM254Q8TBM7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM254Q8TBM7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM254Q8TBM7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM254Q8TBM7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM254Q8TBM7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM254Q8TBM7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM254Q8TBM7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM254Q8TBM7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM254Q8TBM7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM254Q8TBM7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM254Q8TBM7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM254Q8TBM7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM254Q8TBM7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM254Q8TBM7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM254Q8TBM7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms